DataColor软件轻松绘制热图、基因密度图、ks图等

概述

       随着高通量组学技术快速发展，伴随着大生物数据的快速增加，对多维和大数据可视化的需求正不断增加。技术高速创新科研人员开发了各种生物信息学软件、软件包等工具来绘制可视化图，但是也要求使用者掌握各种编程语言的基础。越来越多的用户需要全面、快速、简便、直观地检索大数据中包含的信息。更加便捷的大组学数据可视化来解决生物学问题极为重要。

       为此，我们设计了可视化软件DataColor。该工具提供了全面的调节参数，并集成了大量通用的基础与聚类热图，以及等高图、三维图、三维聚类图、三维散点图、树形图、日历热图、气泡图、网络图、地理图、词云图、解剖图等，并可以在同一平台上比较23种绘图工具下的结果。

下载

DataColor软件制作了三大系统版本，包含Windows、Mac、Linux。

Github下载链接

https://github.com/frankgenome/DataColor/releases

使用说明书和测试数据链接

GitHub - frankgenome/DataColor

界面介绍

1. 工具区域
2. 显示区域
3. 输入文件区域
4. 参数区域
5. 运行和保存区域
6. 文档区域

工具使用

使用示例

        在左侧工具区域选择工具，以下示例选择的是Wide format工具。

 操作说明

1.首先点击右侧的file按钮，选择需要可视化的Csv格式或Excel格式文件

2.已设置默认参数，如需调节参数请看下方介绍

• 设置X轴和Y轴的开启关闭、字体、字号、颜色、旋转角度以及步长
• Scale-min和Scale-max 可以自定义Color bar的数值范围，也可以选择None，由系统自动定义。
• show data可以在热图上显示每个方格的数据值，还可调节数据值的显示字号。
• Scale lable 分为out、into、in，调节X、Y坐标轴的标签齿的朝向。
• Cell square是将热图每一个产生的小方格转为正方形。
• Color bar设置了其方向、标签字号、标签名、大小、颜色。
• color map包含166种，主要分为以下四大类：Sequential colormaps：连续化色图、Diverging colormaps：两端发散的色图、Qualitative colormaps：离散化色图、Miscellaneous colormaps：其它色图。如'Accent', 'Accent_r', 'Blues', 'Blues_r', 'BrBG', 'BrBG_r'等，每种后缀 _r 颜色图是原本的色条水平翻转。
• Line widths是热图的分割线，如果需要可以调节颜色，将宽度选择大于0的数值即可。

3.完成所有配置后，单击“Run"按钮显示或更新热图，热图会在左侧的画布中出现。

4.用户可以通过右键单击“Save”导出选项来导出热图，DataColor提供300-1000dpi 4个档位的图片供用户使用。有png、.jpg、pdf、.svg四种图片格式，以满足不同的需求。

结语

       完整工具操作说明在以下链接中 https://github.com/frankgenome/DataColor

       欢迎大家多多支持和使用DataColor软件！