1.Ubuntu安装
1.1生成exe
官网TRAVIS - Trajectory Analyzer and Visualizer (travis-analyzer.de)
用您选择的标准文本编辑器(txt)打开名为“Makefile”的文件。在第一行中,可以看到条目“CXX = g++”。用你想要使用的c++编译器替换“g++”。(可以是g++,使用gcc时生成了子目录但没生成exe)(g++怎么安装移步(7条消息) Ubuntu12.0安装g++过程及其报错_苏格666的博客-CSDN博客_sudo apt-get install g++)
1.2路径设置
参照以下两条
(9条消息) ubuntu 下设置路径PATH变量_wuguangbin1230的博客-CSDN博客_ubuntu. 配置path路径
(9条消息) ubuntu下添加路径到PATH_corelone2的博客-CSDN博客_ubuntu添加路径
我使用的是:
$ sudo gedit ~/.bashrc
会以可编辑的形式打开,而不是终端。然后最后一行加上,后面没有引号;
export PATH=$PATH:/home/xxx/travis-src-220729/exe
最后重启生效!
使用$ sudo gedit ~/.profile 在最后一行加上后没有生效。
还有一种临时生效的方法:
export PATH=$PATH:/xxx/xxx
2.使用
在有目标文件的文件夹内打开终端,输入:
travis HISTORY
就用travis系统打开了HISTORY文件(HISTORY文件是DL_POLY产生的)。
按照你想要的条件选择y/n,一般默认的就行。
我第一次使用需要注意到:(几个不是默认值的)
- 开始阶段,有一个问你是不是包含哪些元素,如Cs,有就有没有就没有,不然全给你弄成C了;
- 在进行完一个功能后,如rdf,它会问你还要不要添加其他观测,一般是要看几对rdf的,继续添加就可;
- 最后会问你观测的总步长,我是看CONTROL文件里自己写了分子动力学模拟了多少步;
最后有个输出几个输出文件,两个形式的,一个是agr和csv(可以用excel打开)。
想看自己在这次travis中输入了什么命令及系统让你选择了什么,都可以在travis.log里看到。