robocrystallographer
robocrystallographer是一个能将CIF,POSCAR等晶体结构文件转成文字描述的软件包,在材料性质预测,材料生成等模型预处理中常用到,可以作为文字数据结合图网络输入,也可以作为直接的大模型数据
安装问题
python3.9环境下载github源码,地址为https://github.com/hackingmaterials/robocrystallographer/archive/refs/tags/v0.2.8.zip,结果出现报错,
File “pymatgen/core/periodic_table.py", line 526, in from_Z
raise ValueError(f"Unexpected atomic number {Z=}")
ValueError: Unexpected atomic number Z=119
这个问题主要是因为依赖库安装的版本太高
解决方案
调整pymatgen,ruamel,scipy等版本
最终安装成功版本如下:
pip install pymatgen==2020.12.31
pip install ruamel.yaml==0.17.21
pip install numpy==1.21.0
pip install scipy==1.8.1