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原创零基础入门生信转录组数据分析——导读

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2024-10-18 15:38:25 8795

原创 0测序，耗时63天拿下中科院2区，成本超低，快来学学主流思路

综合多组学分析揭示胃癌铂耐药的亚型和关键机制：KLF9作为一个有前景的治疗靶点的鉴定7.4多组学 + 机器学习 + 实验生信 + 简单实验2025年8月本研究通过多组学整合分析，成功将胃癌分为三个具有明显生物学和临床特征的亚型，其中CS2（基质富集型）预后最差、耐药性最强。研究进一步在单细胞和空间水平揭示了耐药恶性细胞模块（M1）及其与微环境的交互作用，并构建出高性能的预后模型。最终通过实验验证了转录因子KLF9在抑制胃癌进展、降低炎症反应和增强铂类敏感性中的关键作用。

2025-09-11 10:08:01 770

原创【纯生信】0测序0实验，网络毒理学+分子动力学，直接冲10+，新思路这不就来了？

应用网络毒理学、分子对接和分子动力学模拟研究环境污染物乙酰柠檬酸三丁酯诱导口腔鳞状细胞癌的机制10.1网络毒理学 + 分子对接 + 分子动力学模拟纯生信2025年7月本研究通过网络毒理学、分子对接和分子动力学模拟系统揭示了ATBC诱导OSCC的分子机制。ATBC具有致癌性和局部刺激性；通过多数据库筛选出107个ATBC-OSCC共同靶点，其中22个为核心靶点；这些靶点主要富集于细胞增殖、凋亡、PI3K-Akt等癌症相关通路；

2025-09-11 09:57:32 1460

原创【纯生信】0测序0实验，“单细胞转录组＋机器学习”纯生信拿下10分+，机会已经来了，多个疾病或许可以尝试，你还在等什么？

可解释的机器学习引导的单细胞定位破译2型糖尿病的多谱系胰腺失调10.6单细胞转录组 + 机器学习纯生信2025年7月本研究通过开发PanSubPred和PSC-Stat两个机器学习工具，系统揭示了T2D中胰腺多细胞谱系的转录组异质性、星状细胞激活动态、细胞通讯网络重构以及β细胞与非β细胞的功能失调。鉴定出38个新型细胞标志物，增强了对胰腺细胞身份的理解；发现星状细胞激活比例随疾病进展（ND→T2D→PDAC）显著升高；揭示T2D中导管细胞成为通讯枢纽，并推导出具有诊断潜力的15基因签名；

2025-09-10 10:56:20 724

原创 0测序，无返修2个月完成！“多组学＋机器学习”拿下中科院2区！不信你不心动？

综合多组学和机器学习揭示了结直肠癌预后分层和治疗优化的免疫原性细胞死亡相关特征5.9转录组 + 机器学习 + 单细胞生信 + 简单实验验证2025年7月构建11基因ICDRS标志物（StepCox+RSF算法），精准预测CRC预后（AUC>0.84）。发现SPP1+/SLC11A1+巨噬细胞新亚型，揭示其通过TNF信号促癌。提出奥拉帕利为高风险患者潜在治疗药物。ICDRS可分层指导免疫治疗（低风险组响应更佳）。列线图整合ICDRS与临床分期，助力个性化治疗决策。

2025-09-10 10:40:01 958

原创常规疾病又如何？热度依然不减，又来一篇5分+单基因研究，联合单细胞分析，干湿结合经典套路

IGF2BP3作为肺腺癌新的预后生物标志物和治疗靶点Cells5.2转录组 + 简单实验生信 + 实验2025年8月本研究系统阐明IGF2BP3在LUAD中的核心作用：诊断价值：IGF2BP3在LUAD中高表达，与晚期分期、淋巴结转移和不良预后显著相关，可作为独立预后生物标志物。促癌机制调控细胞周期（G2/M期阻滞）和凋亡（诱导BIM表达）驱动肿瘤增殖；重塑免疫微环境（促进Th2极化、抑制CD4+ Tem）介导免疫逃逸。治疗意义。

2025-09-09 12:06:40 791

原创【纯生信思路】GBD常规思路中加上孟德尔，瞬间冲10+，不信你不心动

肥胖分类分层和子宫内膜癌亚型的因果影响：综合孟德尔随机化和全球疾病负担研究2021分析10.1GBD临床数据分析 + 孟德尔随机化纯生信2025年7月【核心发现】疾病负担1990-2021年全球BMI相关子宫癌负担↑136%，高SDI地区（北美/西欧）绝对负担最重，南亚增速最快。主要驱动因素：人口增长（62.3%）>老龄化（24.9%）。2036年预测：ASMR将达1.18/10万，70岁以上人群风险突出。因果机制I级肥胖（BMI 30–34.9）

2025-09-09 11:55:36 776

原创 “多组学＋孟德尔随机化”斩获10分＋！摒弃常规机器学习，南昌大学江西医学院这个思路太强了，换个疾病又是一篇！

综合多组学方法揭示胶质母细胞瘤的关键基因和免疫代谢网络10.1转录组＋蛋白组 + 孟德尔随机化 + 实验验证生信 + 湿实验2025年6月本研究通过多组学整合+孟德尔随机化核心靶点：LGALS9和SELL是GBM的因果驱动基因，分别通过CD39⁺ Treg细胞（介导7%效应）和脑脊液代谢物X-22162（介导16%效应）促进肿瘤进展。功能验证：二者在GBM中高表达，直接调控肿瘤细胞增殖、迁移与侵袭。治疗潜力SELL是优选的药物靶点，甲氯芬那酸（非甾体抗炎药）与其高亲和力结合。

2025-09-08 12:05:17 955

原创【纯生信思路】“公共数据库＋队列分析” 纯生信拿下6分+，拿捏小众选题，吉林大学这个思路超有价值！

血清全氟烷基和多氟烷基物质水平与牙线使用的关系：牙线使用的双刃剑-一项横断面研究6.73NHANES数据库数据获取 + 队列分析纯生信无需实验2025年6月核心发现：牙线使用者血清PFOA浓度显著升高（+2.8%），但其他5种PFAS（PFHSA/PFOSA/PFDA/MeFOSAA/PFNA）及综合负担均降低，支持牙线使用整体降低PFAS暴露的“净获益”。机制推测：牙线含PFAS（如PTFE材质）可能直接贡献PFOA暴露；

2025-09-08 12:04:21 809

原创【生信+实验】“传统中药+现代科技”双剑合璧挑战5+：当归饮子通过多靶点调控治疗慢性荨麻疹！

特别提示：今天这期内容对追求思路创新的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 方法常规”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是我们非常熟悉的套路“成分分析+网络药理学+分子对接+体内外实验验证”，生信+实验斩获5分+，快来看看吧！

2025-07-23 15:32:09 1508

原创【纯生信思路】机器学习+分子对接挑战10+，多组学→机器学习→结构验证三连击，黄曲霉毒素肝癌网络全揭秘！！！

特别提示：今天这期内容对追求思路创新的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 方法常规”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是我们非常熟悉的套路“网络毒理学 + 机器学习 + 分子对接”，纯生信斩获10分+，快来看看吧！

2025-07-23 15:31:19 1651

原创 “单细胞+多组学＋孟德尔随机化”狂揽10分＋！南方医科大学这个思路太野了，速来抄作业！

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2025-06-24 08:37:46 901

原创 “临床特征研究＋网络毒理学”斩获6分＋！四川大学华西医院这个思路太新了，硬是在主流的基础上玩出花了！

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2025-06-24 08:23:03 1918

原创【纯生信思路】0测序0实验，“公共数据库＋队列分析” 纯生信拿下7分+，南京鼓楼医院这个思路太强了

今天这期内容对不追求高分的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 超级容易复现”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是非常流行的临床数据库挖掘“NHANES + 队列分析”，纯生信斩获8分+，快来看看吧！

2025-06-23 15:36:27 1322

原创零基础入门转录组数据可视化——圆角堆叠图【Nature级绘图】

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍环状差异热图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-06-23 15:35:03 258

原创【纯生信思路】0测序0实验，“转录组＋机器学习 + 单细胞”纯生信拿下5分+，换个疾病你也可以！！

今天这期内容对不追求高分的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 超级容易复现”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是非常常规的“转录组 + 单细胞 + 机器学习”，纯生信斩获5分+，快来看看吧！

2025-06-09 09:12:58 1656

原创【纯生信思路】最新思路它来了！“网络毒理学＋机器学习”纯生信拿下6分+！生信的崛起还在发力

今天这期内容对不追求高分的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 超级容易复现”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是最近非常非常非常热门的“网络毒理学 + 机器学习”，纯生信斩获6分+，快来看看吧！

2025-06-09 09:12:17 1536

原创【纯生信思路】“NHANES+GBD+孟德尔随机化”斩获6+，江苏省人民医院这个思路太强了，换个疾病又是一篇

今天这期内容对新手伙伴和不追求高分的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 容易复现”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是我们非常熟悉的“NHANES + GBD + 孟德尔随机化”，纯生信斩获8分+，快来看看吧！

2025-05-30 14:35:18 1410

原创【纯生信思路】无返修43天接受！“巨噬细胞+多组学＋机器学习”纯生信拿下中科院2区！不信你不心动？

今天这期内容对不追求高分的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 容易复现”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是我们非常熟悉的“巨噬细胞 + 多组学 + 机器学习”，纯生信斩获5分+，快来看看吧！

2025-05-30 14:35:14 1105

原创 “多组学＋机器学习”斩获10分＋！天津市肿瘤医院这个思路太强了，换个疾病又是一篇！

今天这期内容对追求高分的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 容易复现”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是我们非常熟悉的“多组学+机器学习+实验验证”，生信+实验验证斩获10分+，快来看看吧！

2025-05-26 09:07:51 1609

原创【纯生信思路】NHANES 临床数据分析斩获8+，换个疾病就能同款复刻，不信你不心动？？？

今天这期内容对新手伙伴和不追求高分的老师们来说非常友好！！“思路简单 + 容易复现”，绝对是大家首选的性价比之王！主角是我们非常熟悉的“NHANES-临床数据分析”，纯生信斩获8分+，快来看看吧！

2025-05-26 09:06:55 1626

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制环状差异热图（美化1）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍环状差异热图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-04-16 16:58:06 313 1

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制差异火山图（美化1）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍美化差异火山图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-04-16 16:57:15 373

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制相关性散点图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍相关性散点图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-27 08:10:41 338

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制相关性热图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍相关性热图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-27 08:09:58 378

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制相对丰度图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍相对丰度图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-25 10:03:43 284

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制染色体定位圆圈图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍染色体定位圆圈图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-25 10:02:57 381

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制交集韦恩图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍交集韦恩图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-04 10:46:51 472

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制差异热图2（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍差异热图2绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-04 10:38:28 291

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制富集分析网络图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍富集分析网络图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-03-03 16:41:32 628

原创零基础入门转录组数据可视化——总览

本内容是生信入门转录组分析——数据可视化（初级）专栏的图片预览，方便大家了解专栏中都有哪些可视化图片

2025-03-03 16:40:29 283

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制富集分析树形图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍富集分析树形图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-27 11:31:21 130

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制差异小提琴图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍差异小提琴图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-26 07:49:22 309

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制富集分析柱状图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍富集分析柱状图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-26 07:48:25 355

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制差异箱线图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍差异箱线图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-25 08:05:53 746 1

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制差异热图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍差异热图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-25 08:04:27 1141

原创零基础入门转录组数据可视化——绘制差异火山图（常规）

转录组数据可视化之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍差异火山图绘制的全过程，包括内容有相关代码和截屏。

2025-02-24 10:49:36 1223 3

原创零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之基因在细胞水平的表达

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2025-02-24 08:49:27 1090

原创零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之不同细胞间差异分析

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2025-02-20 08:22:43 1358

原创零基础入门转录组下游分析——单细胞转录组之细胞注释

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2025-02-20 08:21:31 1017

零基础入门转录组下游分析-GO+KEGG富集分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之lasso模型教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之xgboost（筛选特征基因）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之多因素cox模型教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之随机生存森林模型教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型之多因素cox模型（加逐步回归）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-单因素cox筛选预后相关特征教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之boruta（训练模型）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之boruta（筛选特征基因）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之SVM-RFE（筛选特征基因）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-机器学习算法之lasso（筛选特征基因）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-加权基因共表达网络分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-DESeq2差异分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-数据处理（TCGA数据库）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-limma差异分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-数据处理（GEO数据库-高通量测序数据）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-数据处理（GEO数据库-芯片数据）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异小提琴图（常规）

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2025-02-26

零基础入门转录组数据可视化-绘制富集分析柱状图（常规）

2025-02-26

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异箱线图（常规）

2025-02-25

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异热图（常规）

2025-02-25

零基础入门转录组数据可视化-绘制差异火山图（常规）

2025-02-24

零基础入门转录组下游分析- 染色体定位分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-基因突变分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-GSVA富集分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-GSEA富集分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-免疫浸润之ssGSEA算法教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-免疫浸润之CIBERSORT算法教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-列线图模型（预后）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组数据分析-列线图模型（诊断）教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-基因Wilcoxon秩和检验教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-单基因ROC分析教程配套资源

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2025-02-20

零基础入门转录组下游分析-预后模型的验证教程配套资源

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2025-02-20

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