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RSS订阅转载 转载 gro转lammps
分子模拟python脚本，可以将gro文件转换为lammps，并生成in文件，然后运行。原创H Chávez Thielemann, A Cardellini, M Fasano, et al. From GROMACS to LAMMPS: GRO2LAM[J]. J Mol Model, 2019,25(6).原创采用Linux系统和python2.7编译后可用Windows10和python3.x运行，希望对大家有帮助链接：https://pan.baidu.com/s/1Mrizel
2021-08-07 09:56:18
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原创 分子动力学模拟gro格式转换为 car
转换后的car可在多个分子模拟软件中打开。第一次发博客，欢迎交流讨论。直接上代码：import linecachecartype="{0:<8}{1:<16}{2:15}{3:12}{4:5}{5:7}{6:8}{7:4}" #car格式，第‘8’个取值为0，没有设定格式f=open('as-s.car','w') #手动修改f.write('!BIOSYM archive 3\n')f.write('PBC=ON\n\n')'''本例中有2个残基，30000+原子数，当.
2021-08-07 07:46:27
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空空如也
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