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原创 计算微生物多样性r语言代码

write.table (otu_Flattening, file ="otu_Flattening.csv",sep =",", quote =FALSE) #结果导出。#Gini-Simpson 指数（我们平时常用的 Simpson 指数即为 Gini-Simpson 指数）对微生物多样性的计算主要思路是先进行抽平，使每个样本量的OTU丰富和一致，再按照公式对多样性进行计算。#计算微生物群的alpha多样性指标，包括Simpson，shannon，chao1等。#查看抽平后的每个样本的和。