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下载泛癌相关的数据，然后使用MMP定义好的50个通路，将20000多个（筛选后4000+多个特征），然后一共整理为50个通路（可以理解为50个基于生信知识归纳的tokens）
2025-11-13 17:39:27
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原创 生存分析任务建模以及损失函数
Loss参考自项目：https://github.com/JJ-ZHOU-Code/RobustMultiModel/blob/00d8c10a4d3a14ef0c02584b991b139678e6845d/utils/utils.py。
2025-10-17 20:33:01
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原创 C盘扩容笔记
选择备份分区到镜像文件不会的可以参考：https://blog.csdn.net/qq_39571617/article/details/123474836我选择的是锁定后备份，问题不大。32GB的D盘内容压缩成镜像只有19GB。
2025-09-13 21:26:23
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原创 强化学习中重要性采样
然后，在计算颜色时，为那些射向光源的光线赋予较低的权重（因为你发射了太多条了），为那些射向黑暗角落的光线赋予较高的权重（因为你发射的很少）。重要性采样的应用：我们仍然使用旧策略的数据，但在用这些数据计算新策略的收益时，给每一条数据都加上一个重要性权重：权重 = (新策略采取旧行动的概率) / (旧策略采取旧行动的概率)。反之，如果你偶尔在岸边捞到一条小鱼，你会想：“这条鱼虽然小，但它来自一个我几乎不采样的‘低产区域’，它能被捞上来非常难得，它的价值应该被放大。比如，在模拟时故意让股价的波动性变大。
2025-09-13 21:14:01
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原创 json的indent=4能占用多少空间xxx
有一天我一个5GB的json文件，使用indent=4的方式另存了一下，突然变成一个7GB的json文件…应该是挺多行数的，大概有千万行以上吧，然后就导致了突然多了2GB的大小。所以以后大文件一般就不要设置indent了。小文件可视化才需要indent。
2025-09-10 14:55:36
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原创 MedSAM踩坑
然后保存figure的时候去看github上有一个issue，他说需要*255，改完之后就能看到segment的效果了。胸片解剖区域分割不如直接上torchvisionxray。感觉还是有点一般般，病变区域并不是泛化得很好。因为medsam感觉胸片上效果比较一般。只需要github clone。虽然MedSAM上手很简单。不需要使用medsam。
2025-08-13 16:41:23
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原创 论文阅读 2025-8-3 [FaceXformer, RadGPT , Uni-CoT]
最近ICCV 2025很多工作都release了，赶紧跟一波热度了解一下大家在做什么。
2025-08-09 18:23:58
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原创 window的WSL怎么一键重置
也就是说，这个大文件不在WSL里面，但是spacesniffer又只想这个大文件在WSL里面，真的不知道该怎么办了。之前用WSL来在windows和服务器之间传输数据，所以有很多数据缓存，但是现在找不到他们的路径，所以想直接重置。注意，一定得 管理员权限 打开 powershell，不能cmd，也不能普通用户。看起来，这个WSL真的占用了很多空间，但是我又不知道该怎么删除。这个drivers都用了300GB了。结果发现全部都是小文件啊，我服气了。然后我尝试在WSL里面找。看来只能尝试重装WSL。
2025-07-27 19:47:16
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原创 将 cuda 12.1 升级到 cuda 12.4 版本然后vllm来训reasoning
参考官网链接如下：https://developer.nvidia.com/cuda-toolkit-archive。
2025-07-06 01:50:28
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原创 图片太大，该怎么进行resize，才能尽可能少降低损耗？
我使用了下面的代码测试了一下这样子压缩的MSE，发现损耗很小，基本小于1，跟原图基本上差异不大，肉眼看不出来，大模型应该也能够适应把。但是如果你担心图片resize之后不够适用，不能够泛化到别的模型，那么你可以找一个最大的分辨率进行等比例压缩。因为一些常见的模型，比如medgemma，它使用的图片大小是896*896，而且是没有padding的。那么我图片就可以把最短边压缩到1024长度，最长边等比例压缩。如果按照原来的分辨率，那么图片大小就会传输半天，超级久。我们可以通过压缩图片的方式，降低几倍的空间。
2025-06-27 13:32:26
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原创 【删除的目录下有其他硬盘的挂载点 - 导致误删】为什么不是链接的文件也会同时被删除？
为什么不是链接的文件也会同时被删除？在删除数据之前，我特地看了一下是不是链接（软连接/硬链接）然后发现不是然后我就安心地remove了比如一个数据在 /mnt/tmp_home 这是之前备份系统的时候的数据然后他居然和home是绑定的我就觉得奇怪，为啥不是同一个目录都能关联？首先然后发现mnt没有问题，他是独立硬盘但是 mnt/tmp_home 他有问题啊他和home居然是同一个逻辑卷的。。。。谁知道他居然mount上去了xxxx然后我使用 findmnt 发现lv01挂载到这两个地方。
2025-06-27 01:22:04
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原创 大模型解码基础知识笔记
最简单直接的策略，每一步都选择当前概率最高的词。贪心解码是所有解码策略中最基础的一种。它遵循一个简单的原则：在生成序列的每一步，都毫不犹豫地选择模型预测出的概率最大的那个词（Token）。
2025-06-26 23:35:21
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原创 字符串的向量处理技巧：KD树和TF-IDF向量
代码来源：https://github.com/zhaozh10/ChatCAD/blob/main/search_engine/src/db.py。当你有一个 (vocabs, document, library) 时，你可以用TD-IDF向量作为document的向量。一个sentence的TD-IDF向量就是这个句子的所有token的TD-IDF值而已。KD-Tree 搭建以字符串向量为索引的树，以。的时间复杂度快速查找到最近的向量。
2025-06-10 01:02:51
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原创 latex写作踩坑经验
可以人工调节成为 5pt，不影响字体，比较不影响可读性。如果列宽距很挤了，字体很小了，那么只能resizebox了。，neurips 使用的就是这个大小。控制表格的字体，一般使用。
2025-05-12 19:51:49
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原创 latex中 \par, \newline 和 \\ 之间的区别
在表格里面使用 \newline，他会认为是 cell内部的换行，而 \ 则认为是表格行换行。在文章段落、表格之中，他们虽然都是换行的意思，但是实际是不一样的。最后我是使用 \parbox[t]{} 达到目的的。
2025-04-26 00:30:32
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原创 apt --fix-broken install报错? Nvidia-driver没办法安装x
apt --fix-broken install报错是很常见的事情他不会真的给你fix错误，他想要做的事fix broken但是这个broken没办法fix的时候，就会一直报错所以我们需要remove掉之前错误安装的包因为这个错误安装的包没办法安装，所以是没办法fix的，所以是一定要remove的！但是remove命令往往由依赖于fix！就连特定删除purge都不行找到真的解决方法了！！！！！
2025-04-22 20:32:21
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原创 [llava框架] 关于llava框架中微调问题
使用peft模型进行微调，model_base是基于llava的。训练中断之后加载checkpoint，却发现没有non_lora_trainable.bin文件。然后发现最后lora微调出来的non_lora_trainable.bin文件居然是跟随机初始化一样的。。。这一句话assert False了。但是lora权重是微调成功的，不然loss也不会下降。输出的norm值一直都是这个，但是loss神奇地下降。
2025-04-10 00:59:32
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原创 LLM微调失败的经历
反正chexagent的微调使用llava的多轮对话框架真的很难顶，但是chexagent又没给训练代码，有点坑了。也不知道要不要微调embedding，embedding这么大我也没微调过啊。啊这，原来是converstations template的问题。，所以可能会出问题。目前重新训练，后续看看有没有问题。反正看起来就不能单纯用lora微调了。拼接，但是我用的llava默认的，就是。，但是实际上chexagent是。多轮对话，轮次之间要用。
2025-04-05 14:59:34
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原创 UnavailableInvalidChannel: HTTP 404 NOT FOUND for channel anaconda
感觉像是平时在复制指令的时候不小心设置了这个，被别人坑了。使用vim打开文件，在vim命令行中输入。
2025-03-30 01:41:44
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原创 [医学图像数据的预处理工作] 关于dicom格式怎么处理成为nii.gz为后续使用，以及mask配准
当然我觉得如果能一步提取到目标数据，那肯定是最好的，如果不行，那就多步去做。
2025-03-08 17:07:55
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空空如也
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