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原创 利用Cellranger对单细胞数据进行上游分析
当我们从NCBI上下载好相应文章的转录组数据后,便需要对其进行上游分析和下游分析的探究。而由于我们现在测序通常采用10×Genomics单细胞转录组测序技术,其公司开发的Cellranger便成为现在不可或缺的单细胞测序分析软件,在此我们便对其用法进行相应介绍和学习。
2023-08-04 16:51:48 1133 2
原创 Linux系统中已知SRR号如何从NCBI上下载SRA数据到服务器中
高通量组学数据目前已经成为生物研究的重要板块,对于一些文章中出现的数据的挖掘尤其是人体数据的再利用也成为探究科学问题的重要前沿组成。通常情况下文章的高通量数据需要上传到NCBI的SRA(Sequence Read Archive)供大家下载学习,而我们也可以通过多种方法对数据进行下载再挖掘。如果仍然出现问题,请再次检查PATH设置是否正确,并确保在PATH中包含了sra-toolkit的bin目录。首先,我们在下面的网址中进入SRA Toolkit下载的官网。我们在NCBI上找到我们需要的数据的。
2023-08-01 16:59:24 1579 1
空空如也
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