【PubMed】生物医学文献数据库检索指南

【文献检索一般步骤】

搜索关键词，筛选结果，阅读摘要，获取全文。

第一步：访问PubMed

• 打开浏览器并进入PubMed网站（https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/）。

第二步：构建查询

• 在PubMed首页的搜索框中输入相关关键词、作者姓名或其他描述您所需文章的条件。
• 您可以使用布尔操作符（AND、OR、NOT）组合多个搜索词以获得更精确的结果。
• PubMed还支持高级搜索选项，包括特定字段搜索（例如标题、作者、期刊等）和过滤器（例如发表日期、文章类型、语言等）。您可以通过单击搜索框旁边的“高级”链接访问这些选项。

第三步：精炼搜索结果（可选）

• 执行搜索后，PubMed将显示一份相关文章的列表。
• 您可以使用左侧提供的过滤器，如发表日期、文章类型、物种等，进一步细化搜索结果。这些过滤器允许您根据具体要求缩小结果范围。

第四步：获取全文文章

• 一旦确定感兴趣的文章，单击标题查看其详细信息。
• 在文章详细信息页面，将提供一个“摘要”部分，提供文章的摘要信息。
• 要获取全文文章，请单击提供的选项，如“全文”或“PDF”（如果提供）。请注意，不是所有文章都在PubMed上提供全文。在某些情况下，您可能会被重定向到出版商的网站或需要通过订阅或付费方式访问文章。

第五步：保存或导出文章（可选）

• PubMed允许您在PubMed账户中保存感兴趣的文章，创建集合或以各种格式导出文章。
• 要保存文章，请创建一个免费的PubMed账户并登录。然后，对每篇文章使用提供的“保存”或“发送至”选项进行存储，以便将其保留供将来参考。

【检索详情】

1、检索条件：

 想要搜索自己的文献通常直接从「Advanced」进入高级检索界面而不是在输入栏直接输入自己需要的关键词

1）"将术语添加到查询框" 由上到下分别是：

affiliation - 机构/单位

all fields - 所有字段

author - 作者

author - corporate - 作者 - 法人/企业

author - first - 作者 - 名字

author - identifier - 作者 - 标识符

author - last - 作者 - 姓氏

book - 书籍

conflict of statements - 陈述冲突

date - completion - 完成日期

date - create - 创建日期

date - entry - 录入日期

date - mesh - MeSH日期

date - modification - 修改日期

date - publication - 出版日期

ec/rn number - EC/RN编码（酶委员会/注册号）

isbn - ISBN号

investigator - 研究者

issue - 期刊期数

journal - 期刊

language - 语言

location id - 位置标识

mesh major topic - MeSH 主题

mesh subheading - MeSH 副主题

mesh terms - MeSH 术语

other term - 其他术语

pagination - 分页

pharmacological action - 药理作用

publication type - 出版类型

publisher - 出版商

secondary source id - 次要来源标识

subject - personal name - 个人姓名主题

supplementary concept - 附加概念

text word - 文本词

title - 标题

title/abstract - 标题/摘要

transliterated title - 音译标题

volume - 期刊卷号

2）常用的检索条件主要包括：

「自由词、规范主题词（MeSH）、文献作者、期刊名称、文献出版年代、文献类型、文献语种、物质名称」 这几类。

2、自由词与规范主题词：

1）自由词检索

即是输入与检索信息相关的任意词（组），检索的结果为文献题名内和摘要内包含输入单词的文献。

2）规范主题词检索

规范化的检索语言，它对文献中出现同一概念词汇的书写形式具有严格的规范控制。PubMed 中的规范主题词为 MEDLINE 数据库中规范化的 MeSH。

3）需要注意

PubMed 界面具有智能检索的功能，对输入的每一个自由词它将会自动进行自由和规范主题词双重检索。

例子：

如果我们想在数据库中搜索维生素 H 相关文献，直接在「All Fields」中输入「vitamin H」

实际检索式为：

“biotin”[MeSH Terms] OR “biotin”[All Fields] OR “vitamin h”[All Fields]

注：Biotin 为 vitamin H 的规范化 MeSH。

也就是说，要想找到自己需要的文献，不仅从通用词汇入手也要根据行业相关性加上规范化术语

【实践】

老师抛给我了：IRE, HIFU, MWA, RFA，Liver caner，hcc 这几个术语让我去pubmed查相关文献。

刚开始我去查的时候，结果是：

 由于文章检索得到的数量太少，不满足大条件，就去找老师请教，请教后得知，查pubmed文献时要把目标范围划大，也就像上面所说的例子那样多词一意再多查几遍。

所以我分析了老师给的每一个术语的意思/全称/相关意思：

IRE：Irreversible electroporation不可逆性电穿孔，用于肿瘤消融技术
HIFU：High Intensity Focused Ultrasound高强度聚焦超声消融
MWA ：Microwave Ablation微波消融
RFA：Radiofrequency Ablation射频消融
Liver cancer：肝癌
hcc：Hepatocellular Carcinoma，HCC肝细胞癌

然后在这些全称中选择electroporation、ultrasound、liver三个关键词进行检索，获得语句：electroporation AND ultrasound AND liver

 一共有208篇搜索结果，老师说这个符合初步检索数量需求。实践完成

当然，如果要搜的更精细，在相关关键词前选择相关限制词即可（见下图）

【步骤总结】

1、自己需要查找的文章的关键词

2、拓展每个关键词的大意，达到多词一意

3、检索论文时选择3个关键词进行大范围搜索，使用适当的布尔运算符（如AND、OR、NOT）来组合关键词。

 每输入一个关键词和布尔运算符时query box就会自动显示pubmed检索语句，这个语句很重要，基本上数据库进行搜索时的标准规范语言就是它

【注】

1、PubMed是一个包含各个学科的数百万篇科学文章的庞大数据库。搜索结果和可用功能可能因具体文章和PubMed提供的功能而异。

2、尽管PubMed提供摘要和一些全文文章的访问，但并非所有文章都可以免费访问。访问某些文章可能需要订阅或通过机构图书馆访问。

3、MESH是指医学主题词（Medical Subject Headings）。

MESH是一种用于对生物医学文献进行主题分类和索引的术语集合。它由国家医学图书馆（National Library of Medicine）开发并维护，用于提供统一的主题词标准，以便研究人员和医学专业人员可以更方便地查找和访问与特定主题相关的文献。

MESH词汇包括多个层次的术语，从更广泛的主题到更具体的主题，以形成一个层次结构。每个MESH术语都有一个唯一的标识符和相关的术语名称。在Pubmed中，使用MESH词汇可以帮助用户更准确地定位和检索与特定主题相关的文献。通过使用MESH术语，用户可以根据特定的医学主题进行检索，从而提高文献检索的准确性和相关性。

在Pubmed中使用MESH词汇进行检索时，可以使用"MESH Terms"字段来指定特定的主题进行检索，并将MESH术语与其他检索词组合使用，以缩小搜索范围并获取更相关的文献结果。

4、在Pubmed中，AND、OR、NOT是逻辑运算符，用于构建更复杂的检索语句，以便更精确地获取符合特定条件的文献。下面是对每个逻辑运算符的详细说明以及一些例子：

1）AND（与运算）：AND运算符将两个或多个术语组合在一起，要求检索结果必须同时包含所有指定的术语。
a) 示例1：cancer AND therapy
这个检索语句将返回同时包含"cancer"和"therapy"这两个关键词的文献，有助于获取与癌症治疗相关的研究。
b) 示例2：diabetes AND (treatment OR management)
这个检索语句将返回同时包含"diabetes"并且包含"treatment"或"management"其中一个术语的文献，有助于获取关于糖尿病治疗或管理的研究。

2) OR（或运算）：OR运算符将两个或多个术语组合在一起，要求检索结果至少包含其中一个术语。
a) 示例1：heart disease OR cardiovascular
这个检索语句将返回同时包含"heart disease"或"cardiovascular"其中一个术语的文献，有助于获取关于心脏疾病的研究。
b) 示例2：depression OR anxiety OR stress
这个检索语句将返回同时包含"depression"、"anxiety"或"stress"其中一个或多个术语的文献，有助于获取与心理健康相关的研究。

3) NOT（非运算）：NOT运算符用于排除包含指定术语的文献，将其从检索结果中排除。
a) 示例1：obesity NOT children
这个检索语句将返回包含"obesity"但不包含"children"这个术语的文献，有助于获取与肥胖相关的成人研究。
b) 示例2：smoking NOT cessation
这个检索语句将返回包含"smoking"但不包含"cessation"（戒烟）这个术语的文献，有助于获取与吸烟相关的未戒烟研究。

请注意，在构建复杂的检索语句时，使用括号来明确运算的优先级是很重要的。括号可用于将各个术语组合在一起，确保正确的逻辑运算顺序。例如，在示例2中的检索语句中使用了括号来确保"treatment"和"management"被同时与"diabetes"关联，而不是与整个检索语句进行OR运算。

【参考资料】

[1] PubMed文献检索的详细技巧方法：https://www.sci666.com.cn/50397.html