R语言ggplot2可视化:使用ggpubr包的ggmaplot函数可视化MA图(MA-plot)、genenames参数配置点标签对应的基因名称

本文介绍了如何使用R语言的ggplot2和ggpubr包来绘制MA图,并通过ggmaplot函数的genenames参数设置点标签显示基因名称。MA图常用于基因组或转录组数据的可视化,展示基因丰度和表达变化的关系。ggpubr提供了一套易于定制的出版级图形功能,简化了ggplot2的复杂语法。

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R语言ggplot2可视化:使用ggpubr包的ggmaplot函数可视化MA图(MA-plot)、genenames参数配置点标签对应的基因名称

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R语言ggplot2可视化:使用ggpubr包的ggmaplot函数可视化MA图(MA-plot)、genenames参数配置点标签对应的基因名称

导入包和库

 R语言ggplot2可视化:使用ggpubr包的ggmaplot函数可视化MA图(MA-plot)、genenames参数配置点标签对应的基因名称


导入包和库

library(ggplot2)

#install.packages('ggpubr')

library(ggpubr)

Hadley Wickham创建的可视化包ggplot2可以流畅地进行优美的可视化,但是如果要通过ggplot2定制一套图形,尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形,对于那些没有深入了解ggplot2的人来说就有点困难

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