基于华为鲲鹏云服务器迁移和Megahit项目代码的调优实践

题目：基于华为鲲鹏云服务器迁移和Megahit项目代码的调优实践
1鲲鹏应用需求分析
通过鲲鹏开发套件可实现对海量代码进行快速扫描和分析，并提
供专业的代码移植指导，以及移植后全面的系统性能分析与可视化呈
现，从而极大提升软件开发者移植与调优效率。既可以使用该工具分
析可迁移性和迁移投入，也可以使用该工具自动分析出需修改的代码
内容，并指导我们如何修改。
对于PortingAdvisor（代码迁移工具）既解决了我们软件迁移评
估分析过程中人工分析投入大、准确率低、整体效率低下的痛点，通
过该工具能够自动分析并输出指导报告；也解决了代码兼容性人工排
查困难、迁移经验欠缺、反复依赖编译调错定位等痛点。
所以我们通过利用鲲鹏开发套件中的工具来进行鲲鹏代码迁移
和完成Megahit项目代码的调优实践。
2安装工具
2.1登录弹性云服务器ECS
LANG=en_us.UTF-8sshroot@EIP（将EIP改为你的公网IP）

2.2准备工具源码包
在Terminal窗口中执行以下命令下载源码包：
Wgethttps://mirror.iscas.ac.cn/kunpeng/archive/Porting_Dependency
/Packages/Porting-advisor_2.3.0_linux-Kunpeng.tar.gz

用PortingAdvisor（代码迁移工具）实现python包源码迁移。通
过鲲鹏开发套件可实现对海量代码进行快速扫描和分析并提供专业
的代码移植指导，以及移植后全面的系统性能分析与可视化呈现，从
而极大提升软件开发者移植与调优效率。
执行以下命令解压源码包：
tar-zxvfPorting-advisor_2.3.0_linux-Kunpeng.tar.gz

2.3安装porting工具
执行以下命令进入已解压源码包目录:
cdPorting-advisor_2.3.0_linux-Kunpeng

执行以下命令安装porting工具：./installweb

安装成功如下图所示：

2.4安装工具cmake
执行以下命令下载cmake工具:cd~&&wget
https://cmake.org/files/v3.3/cmake-3.3.2.tar.gz
下载成功如下图所示:

执行以下命令解压cmake安装包：
tar-xzvfcmake-3.3.2.tar.gz

执行以下命令编译cmake

编译成功如下图所示:

依次执行以下命令安装cmake工具:
gmake
makeinstall

安装成功如下图所示:

3配置VSCode环境

3.1配置远端服务器连接
点击打开“VisualStudioCode”，打开点击鲲鹏Porting工
具图标，点击“ConfigureServer”配置远端服务器连接，如下图
所示:

（1）“IpAddress”：填写1.1步骤查看到的公网IP；（2）“HTTPS
Port”：默认（8086）；说明：云服务器的弹性公网IP地址，可以
通过鼠标移动到云桌面浏览器页面中左侧菜单栏,点击“服务列表”
->“计算”->“弹性云服务器ECS”进入服务器列表，进行查看并复
制；1.说明：云服务器的弹性公网IP地址，可以通过鼠标移动到云
桌面浏览器页面中左侧菜单栏2.点击“服务列表”->“计算”->“弹
性云服务器ECS”进入服务器列表，进行查看并复制；（3）“Service
CertificateSettings”，可选择“Trustthecurrentservicecertificate”。
填写完成点击“Save”，保存成功后如下图所示：

则需要手动修改VSCode的代理服务器，点击
settings->Application->proxy:“ProxyStrictSSL”选项不勾选，“Proxy
Support”设置项，下拉框内选择“off”,然后再配置服务器页面重新
点击保存即可，如下图所示：

3.2注册并登录
点击“LogIn”，创建用户“devadmin”，密码自定义，如
vcIL6Koun4LstG7o，如下图所示:
设置完成点击“OK”完成远端服务器连接配置。
4源码准备
Terminal窗口执行以下命令进入鲲鹏代码迁移工具源码文件存
放路径：cd/opt/portadv/portadmin/sourcecode/
执行以下命令下载Megahit源码:Gitclone
https://codehub.devcloud.cn-north-4.huaweicloud.com/experiment00001/
megahit.git,下载成功如下图所示：

执行以下命令将代码进行合并：cdmegahit&&gitsubmoduleupdate
--init,执行以下命令创建构建文件夹并进入：mkdirbuild&&cdbuild,
执行以下命令生成Makefile文件：cmake..
-DCMAKE_BUILD_TYPE=Release,执行成功如下图所示：

执行以下命令修改megahit目录群组：cd../&&chown-R
porting:porting/opt/portadv/portadmin/sourcecode/*&&ll./

5源码迁移
5.1代码扫描工具扫描源码并迁移
在打开的“VisualStudioCode”中，点击“LogIn”输入账号
“devadmin”密码（2.2步骤创建的连接密码）,进行连接工具登
录，如下图所示：
登录成功，选择“SourceCodePorting”，手动输入选择“megahit/build”
源码包路径，其他参数默认，如下图所示：（说明：若登录成功时
有弹窗点击“OK”即

点击“Analyze”分析成功如下图所示：

分析完成后，点击文件列表,查看文件中需要迁移的文件，点击“View
SuggestionCode”查看具体文件的迁移建议。修改文件
“megahit_core_popcnt.dir/flags.make”，鼠标拖动到待修改处（向右
拖动到当前代码末尾即可看到）,可以看到一处待修改点，如下图所
示：

删除提示修改代码，修改完成“Ctrl+s”保存该文件，如下图所示：

根据建议提示Kunpengplatform不支持BMI2和POPCNT指令，手
工修改代码，删除指令“-mbmi2”和“-mpopcnt”指令（向右拖动到
当前代码末尾即可看到），修改完成“Ctrl+s”保存该文件如下图所
示：

修改文件“cpu_dispatch.h”，光标悬停到代码上,可以看到修改
建议，所示：

分别在每部分需要修改的代码，鼠标悬停后出现“QuickFix…”，
选择“Replacethecodewiththesuggestedcode”点击进行快速修改，
如下图所示：说明：“QuickFix…”未出现时鼠标滚轮向下滑动即可
看到:

修改完成去掉修改代码注释，“Ctrl+s”保存该文件，最终如下图所
示：

Terminal窗口执行以下命令将“KunpengTrans.h”头文件添加到目录
下到/opt/portadv/portadmin/sourcecode/megahit/src/utils：cp
/opt/portadv/tools/inline_asm/config/KunpengTrans.h
/opt/portadv/portadmin/sourcecode/megahit/src/utils/
5.2重新编译并验证
在Terminal窗口执行make命令：cd
/opt/portadv/portadmin/sourcecode/megahit/build&&make
报错如下图所示:

“/opt/portadv/portadmin/sourcecode/megahitkmlib/kmrns.h”：
vim/opt/portadv/portadmin/sourcecode/megahit/src/kmlib/kmrns.h，
“<x86intrin.h>”为x86平台的系统头文件，在arm平台上没有此系统
头文件。点击键盘“i”命令进入文本输入模式，注释如下图所示代
码：(说明：“#include<x86intrin.h>”改为“//#include<x86intrin.h>”。)

修改完成，点击键盘“ESC”退出输入模式，输入以下命令后回车保
存：:wq再次执行make命令：make，编译通过如下图所示：

编译完成执行以下命令进行验证：makesimple_test
（说明：Makesimple_test里用到的.fa文件是github上下载软件包的
时候就自带了无需额外下载。）
运行成功如下图所示：

至此源码成功迁移。

6个人总结
华为云鲲鹏云服务器以其强大的计算能力和稳定的运行环境，吸
引了众多企业和开发者。在迁移过程中，我深刻体会到了以下几点：
迁移前，详细了解鲲鹏云服务器的架构、性能以及兼容性是非常重要
的。这包括了解服务器的CPU、内存、存储等硬件配置，以及操作系
统、数据库、中间件等软件环境的兼容性。迁移过程中，数据的安全
性和完整性是首要考虑的因素。因此，我在迁移前对原有服务器上的
数据进行了全面备份，并在迁移后进行了数据恢复和验证，确保数据
的完整性和一致性。针对鲲鹏云服务器的特性，我对原有的应用进行
了适配和优化。这包括调整应用的配置参数、优化代码逻辑、提高并
发处理能力等，以充分利用鲲鹏云服务器的性能优势。Megahit是一
个高性能的宏基因组组装工具，我在使用过程中对其代码进行了调优，
以提高其组装效率和准确性。Megahit的组装过程涉及大量的计算任
务，因此我对其进行了并行化处理。通过利用多核CPU和分布式计算
资源，我成功提高了Megahit的组装效率，缩短了组装时间。在调优
过程中，我注重了错误处理和日志记录的重要性。通过完善错误处理
机制、增加日志记录功能，我提高了Megahit的稳定性和可维护性，
方便后续的调试和优化工作。通过华为云鲲鹏云服务器的迁移和
Megahit项目代码的调优实践，我深刻体会到了技术迁移和代码优化
的重要性。在未来的工作中，我将继续关注新技术的发展和应用，不
断提升自己的技术能力和实践经验。同时，我也希望能够与更多的同
行交流学习，共同推动技术的发展和应用创新。
7参考文献
《鲲鹏开发套件最佳实践》
《迁移设计与实施》