案例4_1 病毒感染检测（数据结构）

最新推荐文章于 2023-10-21 18:42:00 发布

躺平大学生er

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分类专栏：头歌文章标签：数据结构算法 c++

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本文探讨了如何使用编程实现病毒DNA序列在人类DNA中的搜索，通过实例说明了如何利用字符串匹配算法检测baa病毒在aaabbba和babbba两个DNA序列中的存在。重点介绍了BF算法在检测环状病毒DNA中的应用。

摘要由CSDN通过智能技术生成

将人的DNA和病毒DNA均表示成由一些字母组成的字符串序列，然后检测某种病毒DNA序列是否在患者的DNA序列中出现过，如果出现过，则此人感染了该病毒，否则没有感染。例如，假设病毒的DNA序列为baa，患者1的DNA序列为aaabbba，则感染；患者2的DNA序列为babbba，则未感染。（注意，人的DNA序列是线性的，而病毒的DNA序列是环状的。)

#include <iostream>
#define maxsiz 20
#include<string.h>
using namespace std;

typedef struct Ssring//串的定长顺序结构
{
    char ch[maxsiz+1];//储存串的一维数组;
    int length;//串的当前长度
}Ssring;
int GetLength(char *L)//得到字符数组的长度
{
    int n = 0;
    char *p = L;
    while(*p!='\0')
    {
        n++;
        p++;
    }
    return n;
}
void inistSstring(Ssring * L)//初始化串
{
    char a[maxsiz];//定义一个辅助数组
    cin>>a;
    char *p= L->ch;//定义一个字符指针，指向串里面的数组
    strcpy(++p,a);//在数组的下标为1的位置开始赋值，注意为了方便，我们不采用0开始的下标
    L->length = GetLength(a);//顺便给长度赋值
}
int index(Ssring L1,char* L2,int pos,int L2_length)//返回模式L2在主串L1中第pos个字符开始第一次出现的位置。如果不存在，则返回值为0
{
    /******************Begin*********************/
	int i=pos;
    int j=1;
    while((j<=L2_length)&&(i<=L1.length))
    {
        if(L1.ch[i]==L2[j]){i++;j++;}
        else{i=i-j+2;j=1;}
    }
    if(j>L2_length) return i-L2_length;
    else  return 0;
    
    /**********************End*******************/
}
int virus_detection(Ssring person,Ssring virus)
{
    int flag = 0;//设置一个标志
    int  m = virus.length;
    char temp[virus.length+1];//定义一个辅助数组，但我们为了方便，储存数据时，在下标为一时开始。所以要length+1个空间
    for(int i = m+1,j=1;j<=m;j++)//将病毒的dna再复制一遍，跟在原来的dna后面。因为病毒dna是循环的。所以，我们要检测它所有的可能
    {
        virus.ch[i++]=virus.ch[j];
    }
    virus.ch[2*m+1]='\0';//别忘记这里
    for(int i=0;i<m;i++)//知道了病毒dna的长度，每循环一次可得到病毒的一种dna序列
    {
        for(int j=1;j<=m;j++)
         {
             temp[j]=virus.ch[i+j];
         }
         temp[m+1]='\0';
         //flag = index(person,temp,1,virus.length);//在这里采用BF算法即可
         flag = index(person,temp,1,virus.length);
		 if(flag) break;
    }
    if(flag)
        return 1;
    else
        return 0;
}
int main()
{
    int n,flag;
    cin>>n;
	while(n--)
    {
	    Ssring L1;
	    Ssring L2;    
	    inistSstring(&L2);
		inistSstring(&L1);
	    flag=virus_detection(L1,L2);
	    if(flag)cout<<"YES"<<endl;
	    else 
	    	cout<<"NO"<<endl;
    }
    return 0;
}