医学大数据|统计基础|医学统计学（笔记）：开学说明与目录

开始学习统计基础，参考教材：医学统计学第五版

点点关注一切来学习吧

责任编辑：医学大数据刘刘老师：头部医疗大数据公司医学科学部研究员

邮箱：897282268@qq.com

久菜盒子工作室 我们是：985硕博/美国全奖doctor/计算机7年产品负责人/医学大数据公司医学研究员/SCI一区2篇/Nature子刊一篇/中文二区核心一篇/都是我们

主要领域：医学大数据分析/经管数据分析/金融模型/统计数理基础/统计学/卫生经济学/流行与统计学/

擅长软件：R/python/stata/spss/matlab/mySQL

团队理念：从零开始，让每一个人都得到优质的科研教育

第一章  绪论……………………………………………………………………………………………………2
第一节  统计学与医学统计学 …………………………………………………………………………… 2
第二节  医学统计学的作用………………………………………………………………………………2
第三节 统计学的几个基本概念…………………………………………………………………………7
第四节 统计学发展简史 ……………………………………………………………………………… 10
第二章  计量资料的统计描述 …………………………………………………………………………… 14
第一节 频数分布 ………………………………………………………………………………………  14
第二节 集中趋势的描述 ……………………………………………………………………………… 17
第三节 离散趋势的描述 ……………………………………………………………………………… 21
第四节  正态分布 ……………………………………………………………………………………… 23
第五节  医学参考值范围的制定 ……………………………………………………………………… 26
第三章  总体均数的估计与假设检验 …………………………………………………………………… 30
第一节 均数的抽样误差与标准误 …………………………………………………………………… 30
第二节 t分布………………………………………………………………………………………………33
第三节  总体均数的估计 ……………………………………………………………………………… 34
第四节  假设检验的基本原理和步骤 ………………………………………………………………… 37
第五节  t检验…………………………………………………………………………………………… 39
第六节  假设检验的注意事项 ………………………………………………………………………… 44
第七节  正态性检验和两样本方差比较的F 检验…………………………………………………… 46
第四章  多个样本均数比较的方差分析 ………………………………………………………………… 55
第一节  方差分析的基本思想及应用条件 …………………………………………………………… 55
第二节  完全随机设计资料的方差分析 ……………………………………………………………… 57
第三节  随机区组设计资料的方差分析 ……………………………………………………………… 60
第四节  拉丁方设计资料的方差分析 ………………………………………………………………… 63
第五节  两阶段交叉设计资料的方差分析 …………………………………………………………… 66
第六节  多个样本均数间的多重比较 …………………………………………………………………  68
第七节  多样本方差比较的 Bartlett 检验和Levene检验 …………………………………………… 71
附  常见基本拉丁方表 … … … … … … … …  ………………………………………………………  73
第五章  计数资料的统计描述 ……………………………………………………………………………  78
第一节  常用相对数 …………………………………………………………………………………… 78
第二节 应用相对数的注意事项………………………………………………………………………79
第三节  率的标准化法 ………………………………………………………………………………… 81
第四节  动态数列及其分析指标………………………………………………………………………85
第六章  几种离散型变量的分布及其应用………………………………………………………………90
第一节  二项分布………………………………………………………………………………………90
第二节 Poisson分布……………………………………………………………………………………96
第三节 负二项分布…………………………………………………………………………………… 100
第七章 x² 检验……………………………………………………………………………………………107
第一节  四格表资料的x² 检验 ……………………………………………………………  …………107
第二节 配对四格表资料的x² 检验………………………………………………………………… 110
第三节  四格表资料的 Fisher 确切概率法……………………………………………………………111
第四节 行×列表资料的X² 检验……………………………………………………………………… 114
第五节 多个样本率间的多重比较 …………………………………………………………………… 118
第六节  频数分布拟合优度的X² 检验……………………………………………………………… 120
第八章  秩转换的非参数检验…………………………………………………………………………… 125
第一节  配对样本比较的Wilcoxon符号秩检验  ……………………………………………………  125
第二节  两个独立样本比较的 Wilcoxon 秩和检验  …………………………………………………  128
第三节  完全随机设计多个样本比较的 Kruskal-WallisH  检验 …………………………………… 131
第四节  随机区组设计多个样本比较的 Friedman M检验………………………………………… 134
第九章  双变量回归与相关……………………………………………………………………………… 141
第一节 直线回归 ……………………………………………………………………………………… 141
第二节 直线相关 ……………………………………………………………………………………… 146
第三节  秩相关 ………………………………………………………………………………………… 151
第四节 曲线拟合……………………………………………………………………………………… 153
第十章  统计表与统计图………………………………………………………………………………… 160
第一节  统计表 ………………………………………………………………………………………… 160
第二节  统计图 …………………………………………………………………………………………  162
第二篇 进  阶  篇
第十一章  多因素试验资料的方差分析…………………………………………………………………174
第一节  析因设计资料的方差分析 …………………………………………………………………… 174
第二节  正交设计与方差分析 ………………………………………………………………………… 181
第三节  嵌套设计资料的方差分析 …………………………………………………………………… 187
第四节  裂区设计资料的方差分析 …………………………………………………………………… 188
第十二章  重复测量设计资料的方差分析……………………………………………………………… 194
第一节  重复测量资料的数据特征 …………………………………………………………………… 194
第二节  重复测量数据的两因素两水平分析 ………………………………………………………… 197
第三节  重复测量数据的两因素多水平分析…………………………………………………………200
第四节 重复测量数据的多重比较 …………………………………………………………………… 204
第十三章  一般线性模型………………………………………………………………………………… 211
第一节 基本概念 ……………………………………………………………………………………… 211
第二节  协变量方差分析模型…………………………………………………………………………215
第十四章  多变量数据常用统计量与组间差别检验…………………………………………………… 223
第一节  描述统计量 …………………………………………………………………………………… 223
第二节  组间差别比较 ………………………………………………………………………………… 225
第三节  重复测量资料的多变量分析 ………………………………………………………………… 233
第四节  轮廓分析 ……………………………………………………………………………………… 234
第十五章  多元线性回归分析…………………………………………………………………………… 242
第一节 多元线性回归 ………………………………………………………………………………… 242
第二节  自变量筛选方法 ………………………………………………………………………………  248
第三节  多元线性回归的应用及其注意事项 ………………………………………………………… 252
第十六章  logistic    回 归 分 析  ……………………………………………………………………………             257
第 一 节  logistic   回归 … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … … …  … 257
第二节  条件logistic 回归 ……………………………………………………………………………  263
第三节  有序和多分类logistic 回归  …………………………………………………………………266
第四节 logistic 回归的应用及其注意事项…………………………………………………………… 268
第十七章  广义线性模型………………………………………………………………………………… 276
第一节  基本概念…………………………………………………………………………………………  276
第二节  对数线性模型 …………………………………………………………………………………  277
第三节  Poisson 回归………………………………………………………………………………… 284
第四节  负二项回归 …………………………………………………………………………………… 287
第十八章  生存分析……………………………………………………………………………………… 293
第一节  基本概念 ……………………………………………………………………………………… 293
第二节  生存分析的统计方法 ………………………………………………………………………… 299
第三节  生存率的估计与生存曲线 …………………………………………………………………… 300
第四节  生存率的比较 ………………………………………………………………………………… 304
第五节  Cox比例风险回归模型……………………………………………………………………… 306
第六节  寿命表 ………………………………………………………………………………………… 311
第十九章  聚类分析………………………………………………………………………………………318
第一节  概述 …………………………………………………………………………………………… 318
第二节  系统聚类 ……………………………………………………………………………………… 321
第三节  k 均值聚类与两步聚类……………………………………………   ……………………………323
第四节  聚类分析中应注意的问题 …………………………………………………………………… 327
第二十章  判别分析………………………………………………………………………………………… 331
第一节  距离判别 ……………………………………………………………………………………… 331
第二节  Fisher 判别 …………………………………………………………………………………… 333
第三节  Bayes 判别…………………………………………………………………………………… 336
第四节 判别分析中应注意的问题……………………………………………………………………… 339
第二十一章  主成分分析与因子分析…………………………………………………………………… 342
第一节  主成分分析……………………………………………………………………………………… 342
第二节  因子分析 ……………………………………………………………………………………… 351
第二十二章  典型相关分析……………………………………………………………………………… 363
第一节 基本思想 ……………………………………………………………………………………… 363
24    目     录
第二节  基本概念………………………………………………………………………………………363
第三节 基本理论………………………………………………………………………………………364
第四节  一般步骤………………………………………………………………………………………366
第五节 应用实例………………………………………………………………………………………367
第二十三章  结构方程模型………………………………………………………………………………373
第一节 概述……………………………………………………………………………………………373
第二节 验证性因子分析与结构效度评价……………………………………………………………377
第三节  结构方程模型分析……………………………………………………………………………379
第四节  应用结构方程模型需注意的问题……………………………………………………………382
第二十四章  多水平模型…………………………………………………………………………………387
第一节 混合模型……………………………………………………………………………………… 387
第二节 方差成分模型…………………………………………………………………………………388
第三节  随机系数模型…………………………………………………………………………………396
第四节 离散数据的多水平模型………………………………………………………………………401
第二十五章  常用综合评价方法…………………………………………………………………………409
第一节 基本概念………………………………………………………………………………………409
第二节 综合评分法……………………………………………………………………………………415
第三节 综合指数法……………………………………………………………………………………417
第四节 层次分析法……………………………………………………………………………………420
第五节 TOPSIS法……………………………………………………………………………………424
第六节  秩和比法………………………………………………………………………………………427
第二十六章  生物信息学中的统计方法…………………………………………………………………432
第一节  序列比对方法 ………………………………………………………………………………… 432
第二节  基因表达谱的数据获取及标准化……………………………………………………………437
第三节  差异表达基因的筛选…………………………………………………………………………439
第四节  基因表达的聚类分析方法 …………………………………………………………………… 441
第五节  基因调控网络分析……………………………………………………………………………449
第二十七章  实效比较与真实世界研究…………………………………………………………………454
第一节  基本概念………………………………………………………………………………………454
第二节 实效比较研究设计……………………………………………………………………………456
第三节  实效比较研究的因果推断分析………………………………………………………………458
第四节  实效比较与真实世界研究案例………………………………………………………………463
第二十八章  健康医疗大数据简介………………………………………………………………………469
第一节 基本概念………………………………………………………………………………………469
第二节 健康医疗大数据的关联性分析………………………………………………………………470
第三节  健康医疗大数据的分类诊断…………………………………………………………………472
第四节 健康医疗大数据的预报预测…………………………………………………………………475
第三篇  设  计  篇
第二十九章  医学科学研究设计概述…………………………………………………………………… 480
第一节  医学科学研究的基本任务与特点……………………………………………………………480
第二节  医学科学研究的分类与研究方法 …………………………………………………………… 482
第三节  医学科学研究的基本步骤……………………………………………………………………483
第三十章  观察性研究设计………………………………………………………………………………489
第一节  基本概念………………………………………………………………………………………489
第二节  横断面研究设计………………………………………………………………………………490
第三节 病例对照研究设计……………………………………………………………………………492
第四节  队列研究设计…………………………………………………………………………………498
第五节  常用抽样方法…………………………………………………………………………………505
第六节  样本含量估计…………………………………………………………………………………507
第七节  调查问卷的编制方法…………………………………………………………………………511
第三十一章  实验研究设计………………………………………………………………………………518
第一节  实验设计的基本要素…………………………………………………………………………518
第二节 实验设计的基本原则…………………………………………………………………………519
第三节 样本含量估计…………………………………………………………………………………522
第四节  常用实验设计类型……………………………………………………………………………526
第三十二章  社区干预试验研究设计……………………………………………………………………535
第一节  基本概念………………………………………………………………………………………535
第二节  完全随机社区干预试验的设计与分析………………………………………………………538
第三节  配对社区干预试验的设计与分析……………………………………………………………545
第四节  分层社区干预试验的设计与分析……………………………………………………………550
第三十三章  临床试验研究设计…………………………………………………………………………556
第一节 基本概念 ……………………………………………………………………………………… 556
第二节  临床试验中的偏倚及控制方法 ……………………………………………………………… 558
第三节  临床试验对照组的选择………………………………………………………………………562
第四节  临床试验设计的常见类型 …………………………………………………………………… 564
第五节 临床有效性的统计学评价 …………………………………………………………………… 566
第六节 诊断试验评价 ………………………………………………………………………………… 569
第三十四章  医学量表研制与应用……………………………………………………………………… 580
第一节  量表结构与编制步骤 ………………………………………………………………………… 580
第二节  信度、效度与反应度分析 …………………………………………………………………… 585
第三节 量表的医学应用 ……………………………………………………………………………… 587
第三十五章  数据预处理与统计分析的基本思路……………………………………………………… 593
第一节 数据的核查 …………………………………………………………………………………… 593
第二节 数据离群值的识别与处理 …………………………………………………………………… 595
第三节 缺失值的识别与处理 ………………………………………………………………………… 597
第四节  统计方法的选择 ……………………………………………………………………………… 599
第五节  数据挖掘 ……………………………………………………………………………………… 602
第六节 应用实例……………………………………………………………………………………… 603
26    目     录
第三十六章  统计结果报告正确表达与规范……………………………………………………………609
第一节  医学论文统计表达的一般要求………………………  ……………………………………  609
		/AA"
第二节  随机对照试验报告的统计表达规范…………………………………………………………612
第三节  观察性研究报告的统计表达规范……………………………………………………………614
第四节 诊断准确性研究报告规范……………………………………………………………………616
第五节  meta 分析的报告规范  ………………………………………………………………………619
第三十七章  医学文献的系统综述与 meta 分析………………………………………………………623
第一节  meta 分析的资料准备与统计方法  …………………………………………………………624
第二节  比值比合并……………………………………………………………………………………625
第三节 两个率差值的合并……………………………………………………………………………627
第四节 两均数差值的合并……………………………………………………………………………629
第五节  meta 分析的注意事项  ………………………………………………………………………631
第三十八章  SPSS 统计软件……………………………………………………………………………637
第一节  基础知识………………………………………………………………………………………637
第二节 基本统计方法…………………………………………………………………………………642
第三节  多元统计分析方法……………………………………………………………………………648
第三十九章  SAS 统计软件 ……………………………………………………………………………655
第一节  基础知识………………………………………………………………………………………655
第二节  数据集创建……………………………………………………………………………………658
第三节 基本统计方法…………………………………………………………………………………662
第四节 多元统计分析方法……………………………………………………………………………675
第四十章  Stata 统计软件………………………………………………………………………………686
第一节 基础知识………………………………………………………………………………………686
第二节  基本统计方法…………………………………………………………………………………690
第三节 多元统计分析方法…………………………………………………………………………… 693
第四十一章  R 软件……………………………………………………………………………………… 697
第一节 基础知识……………………………………………………………………………………… 697
第二节 基本统计方法 ………………………………………………………………………………… 703
第三节 高级统计方法………………………………………………………………………………… 710
第四节 数据可视化……………………………………………………………………………………715
参考文献……………………………………………………………………………………………………721
附录一  医学人口统计与疾病统计常用指标……………………………………………………………  736
附录二  模拟试题…………………………………………………………………………………………745
附录三  统计用表………………………………………………………………………………………… 774
附表3-1  标准正态分布曲线下的面积，φ(u)  值(u≤0)……………………………………………774
附表3 - 2 t 界值表……………………………………………………………………………………775
附表3-3  F 界值表……………………………………………………………………………………777
附表3-4 q 界值表…………………………………………………………………………………… 785
附表3-5  Dunnett-t  界值表(单侧) …………………………………………………………………786
附表3-6  Dunnett-t  界值表(双侧) ………………………………………………………………… 787
附表3-7  百分率的置信区间 ………………………………………………………………………… 788
附表3 - 8 Poisson分布λ的置信区间………………………………………………………………793
附表3-9 x²  界值表……………………………………………………………………………………794
附表3- 10 T 界值表(配对比较的符号秩和检验用) ………………………………………………795
附表3-11 T 界值表(两样本比较的秩和检验用)  …………………………………………………796
附表3-12 H 界值表(三样本比较的秩和检验用)  …………………………………………………797
附表3- 13 M 界值表(随机区组比较的秩和检验用)………………………………………………797
附表3-14 ,界值表……………………………………………………………………………………798
附表3 - 15 r,界值表…………………………………………………………………………………800
附表3-16  随机数字表………………………………………………………………………………802
附表3-17  样本均数与总体均数比较(或配对比较)所需样本含量………………………………804
附表3-18  两样本均数比较所需样本含量…………………………………………………………805
附表3-19 ψ值表(多个样本均数比较所需样本含量的估计用) …………………………………806
附表3-20  两样本率比较所需样本含量(单侧) ……………………………………………………808
附表3-21  两样本率比较所需样本含量(双侧) ……………………………………………………809
附表3-22 λ界值表(多个样本率比较所需样本含量的估计用)…………………………………810