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原创 Monocle3 基本流程复现

教程中的方法是使用new_cell_data_set()函数创建了一个新的 cds对象,这个函数常用于从头开始创建一个新的rds对象。空间共表达效应是指在空间中距离相近的细胞之间基因表达的相似性。在组织或器官中,相邻的细胞可能具有类似的功能和特性,因此它们的基因表达也可能有相似之处。这有助于了解细胞在组织中的空间分布、细胞-细胞相互作用以及细胞特异性的功能。通过寻找拟时轨迹差异基因和研究空间共表达效应,我们可以深入了解单细胞数据中的动态细胞状态和空间结构,为细胞发育和组织功能的研究提供重要线索。

2023-07-20 20:01:18 1195 2

原创 scATAC-seq(Signic)官方分析流程

scATAC-seq(Signic)官方分析流程复现

2023-05-11 17:02:19 1452

原创 Transformer [全网最详细的Transformer讲解]

结合李宏毅老师以及各个大佬讲解,全网最全版本!

2023-02-26 18:55:14 3892

原创 Attention 和 Self-Attention [一万字拆解 Attention,全网最详细的注意力机制讲解]

Attention 和 Self-Attention;结合李宏毅老师和多位up主的讲解,一万字拆解、全网最详细的注意力教程;

2023-02-26 10:00:01 353

原创 从RNN到Attention

上次我们讲到,传统神经网络无法获取时序信息,但时序信息在自然语言处理任务中非常重要!例如 “我吃了一个苹果”这一句话,“苹果” 的词性和意思,取决于前面词的信息,如果没有 “我吃了一个” 这些词,“苹果”也可以翻译为乔布斯的“Apple”。RNN中的Attention注意力模型

2023-02-25 16:28:23 1148

原创 【感知机与神经网络基础知识(入门)】

先看定义公式如下图所示感知机由线性函数和激活函数我们有一组身高体重的二维数据,在直角坐标系标点,随着数据增多我们可以看出数据大致分为两块儿,左上角 “瘦” 的和右下角 “胖” 的。那我我们是不是可以对该数据建模,找出平面中一条直线 y = kx + b,用来区分这些数据呢?假如有这样一条直线或者我们称之为线性函数被拟合出来,那么我们以后只要有一组身高体重数据,带入进去判断函数值是否 >0或者

2023-02-25 12:02:25 248

原创 预训练语言模型基础知识串讲

本文的主题是预训练语言模型的基础知识。

2023-02-24 23:04:05 394

原创 Linux中使用‘readarray‘将文件中的行读取到2D数组中

Readarray用法:将文件中的行读取到2D数组中

2023-02-20 12:16:25 677

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