批量下载GLDAS数据

GLDAS是全球陆面数据同化系统的简称,利用陆面模式以及资料同化技术,提供了理想的陆面变量和能量场,有0.25度和1度的3小时和月数据。ftp://hydro1.gesdisc.eosdis.nasa.gov/data/s4pa/GLDAS/(数据所在ftp地址)

下载方式有

1.通过wget在Linux系统下下载。

a.尝试在虚拟机里下载,首先在虚拟机里挂载了硬盘

在虚拟机终端上:sudo fdisk -l 查看硬盘,决定将sdb2硬盘挂载到mnt下,输入mount ntfs /dev/sdb2  /mnt

b.挂载好硬盘后,进入该硬盘目录下,输入wget ftp://hydro1.gesdisc.eosdis.nasa.gov/data/s4pa/GLDAS/GLDAS_NOAH025_M.2.0/1985/*(以anonymous身份登录了),回车后会自动链接下载。


2.以用户名和密码登录EARTHDATA后,在https://search.earthdata.nasa.gov/search下搜索需要的GLDAS数据,选取需要的数据集后,点击Retrieve Collection data按钮,待生成清单后点击download和submit,然后点击View Download Links,在链接列表里选中所有要下载的数据,单击右键选择DownThem All,就可以进行批量下载了。(Down Them All是火狐浏览器提供的一个支持便捷批量下载的插件,非常好用)


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NCBI(National Center for Biotechnology Information)是一个向公众提供生物技术信息的数据库和资源的机构。在NCBI的Sequence Read Archive(SRA)中,我们可以访问并获取到大量的高通量测序数据,其中包括SRR数据。 要批量下载SRR数据,我们可以按照以下步骤进行操作: 1. 首先,我们需要在NCBI的网站上进入SRA数据库页面。这可以通过在浏览器中输入"SRA NCBI"来搜索并进入。 2. 在SRA数据库页面,我们可以使用不同的搜索选项来找到我们想要下载的SRR数据。我们可以根据物种、实验类型、测序平台等进行筛选。 3. 选择我们想要的SRR数据后,我们需要将这些数据添加到一个“购物车”或“文件篮子”中。这个功能可以帮助我们批量下载数据。 4. 在我们选择了所有需要下载的SRR数据后,我们可以点击购物车或文件篮子页面上的下载按钮。这个按钮通常带有一个下载箭头的图标。 5. 点击下载按钮后,系统将开始生成一个下载链接或下载文件。这个过程可能需要一些时间,具体取决于我们要下载数据量大小。 6. 一旦下载链接或文件生成完成,我们可以点击链接或下载文件来获取我们的SRR数据。这些数据将以压缩文件的形式提供,通常是以".tar"或".gz"的文件格式。 7. 最后,我们可以根据需要解压缩下载的文件,并使用适当的工具和方法来处理这些SRR数据。 总结起来,要批量下载NCBI的SRR数据,我们需要进入SRA数据库页面,搜索并选择我们需要的数据,将其添加到“购物车”或“文件篮子”,然后点击下载按钮来获取数据下载后的数据将以压缩文件的形式提供,我们需要解压缩并使用适当的工具来处理这些数据

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