perl里关于hash一个问题!

 

如果输入文件的list文件格式如下:
          a.txt
          b.txt
          c.txt
                    ……

 而a.txt、 b.txt、 c.txt的格式如下的话:
          simulate1M 1708 INDEL:313 G GA 909
          simulate1M 1744 INDEL:427 AT A 76
          simulate1M 1804 INDEL:612 GCA G 62
          simulate1M 1934 INDEL:652 T TC 62
   ……
将txt文件中第1、2、4、5列相同的最后一列相加;


实现程序:
    如果多维哈希时  $all{$info[1]}{$info[3]}{$info[4]} +=$num;
    请问$all{$info[1]} 存放的是什么呢?
    用这个多维哈希,应该怎么获取它的第二个键值呢? 用keys %{$all{$info[1]}} 好像不得行,那这个里面又存放的是什么呢?

 

#==============================================
最后只得用单值哈希解决了
use strict;
die "perl $0 VCF_LIST_FILE OUTFILE" if (@ARGV!=2);
   my (%all);
   open LIST,"$ARGV[0]" or die $!;
   open OUT,">$ARGV[1]" or die $!;
   while(<LIST>){
           chomp;
           open IN,$_ or die $!;
           while(<IN>){
                   chomp;
                   if (/^#/){
                           next;
                           }else{
                                   my @info=(split /\s+/,$_);
                                   my $key = "$info[1]\t$info[3]\t$info[4]";
                                   print $key;
                                   my $num=$info[-1];
                                   $all{$key} +=$num;
                                   }
                                   }
                 close IN;
    }
    close LIST;

for my $pos (keys %all){
        print OUT "simulate1M $pos $all{$pos}\n";
}
   

 

  • 0
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 2
    评论
评论 2
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值