ssr.pl 是 http://www.gramene.org/db/markers/ssrtool 在线工具的local版本。
用于寻找DNA中的微卫星序列(perfect形式)
ubuntu下,使用方法如下:
[img]http://dl.iteye.com/upload/attachment/242212/0173d24c-69f5-396c-a13d-a568de669064.png[/img]
结果格式,从左到右,依次为:
gi,同一条序列的第几个ssr位点,motif的长度,motif,重复次数,起始位置,终点位置,序列长度.
用于寻找DNA中的微卫星序列(perfect形式)
ubuntu下,使用方法如下:
ssr.pl fasta格式文件
[img]http://dl.iteye.com/upload/attachment/242212/0173d24c-69f5-396c-a13d-a568de669064.png[/img]
结果格式,从左到右,依次为:
gi,同一条序列的第几个ssr位点,motif的长度,motif,重复次数,起始位置,终点位置,序列长度.