Java远程执行Shell命令

1. Jar包

  ganymed-ssh2-build210.jar

2. 步骤：

a) 连接：

Connection conn = new Connection(ipAddr);
conn.connect();

b)认证：

boolean authenticateVal = conn.authenticateWithPassword(userName, password);

c) 打开一个Session:

if(authenticateVal)
   Session session = conn.openSession();

d) 执行Shell命令：

1）若是执行简单的Shell命令：（如 jps 、last 这样的命令 ）

session.execCommand(cmd);

2) 遇到问题：
用方法execCommand执行Shell命令的时候，会遇到获取不全环境变量的问题，比如执行 hadoop fs -ls 可能会报找不到hadoop 命令的异常，试着用execCommand执行打印环境变量信息的时候，输出的环境变量不完整，与Linux主机建立连接的时候会默认读取环境变量等信息，可能是因为session刚刚建立还没有读取完默认信息的时候，execCommand就执行了Shell命令

解决：
所以换了另外一种方式来执行Shell命令：

// 建立虚拟终端
session.requestPTY("bash");
// 打开一个Shell
session.startShell();
// 准备输入命令
PrintWriter out = new PrintWriter(session.getStdin());
// 输入待执行命令
out.println(cmd);
out.println("exit")
// 6. 关闭输入流
out.close();
// 7. 等待，除非1.连接关闭；2.输出数据传送完毕；3.进程状态为退出；4.超时
session.waitForCondition(ChannelCondition.CLOSED | ChannelCondition.EOF | ChannelCondition.EXIT_STATUS , 30000);      

用这种方式执行Shell命令，会避免环境变量读取不全的问题，第7步里有许多标识可以用，比如当exit命令执行后或者超过了timeout时间，则session关闭　　
这里需要注意，当一个Shell命令执行时间过长时，会遇到ssh连接超时的问题，

解决办法：

1. 之前通过把Linux主机的sshd_config的参数ClientAliveInterval设为60，同时将第7步中timeout时间设置很大，来保证命令执行完毕，

因为是执行Mahout中一个聚类算法，耗时最少7、8分钟，数据量大的话，需要几个小时。

2. 后来将命令改成了nohup的方式执行，nohup hadoop jar … >> XXX.log && touch XXX.log.end &

这种方式是提交到后台执行，即使当前连接断开也会继续执行，把命令的输出结果写入日志，如果hadoop命令执行成功，则生成.end文件

获取文件的方法 ganymed-ssh2-build210.jar 也提供了，如下

SCPClient scpClient = con.createSCPClient(); 
scpClient.get("remoteFiles","localDirectory");  //从远程获取文件

e) 获取Shell命令执行结果：

InputStream stderr = new StreamGobbler(session.getStderr());
InputStream in = new StreamGobbler(session.getStdout());