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摘要： 博主在infercnv分析中遇到执行困难，外包服务不可靠（未按要求使用HMM方法）。通过优化策略（逐样本处理、精简细胞至1000个、固定随机种子）解决了运行问题，但HMM功能仍无法实现。最终参考Cell期刊标准设置阈值完成分析，后续将继续更新进展。该案例凸显了生物信息分析中自主优化的重要性。（150字）
2025-11-18 14:31:28
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原创 泛癌分析中批次效应的处理
本文介绍了整合TCGA和TARGET数据库骨肉瘤数据的批次效应处理方法。通过intersect()获取公共基因，合并表达矩阵后使用sva包的ComBat函数校正批次效应。重点包括：1)数据预处理(基因名处理、数值转换)；2)批次变量设置；3)ComBat参数配置(ref.batch设为TCGA参考)。作者指出全矩阵批次校正计算量巨大，建议先筛选目标基因再进行校正以提高效率。该方法适用于不同来源的组学数据整合分析。
2025-11-17 16:16:35
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空空如也
生信分析骨肉瘤泛癌分析
2025-11-15
关于enhancer和启动子和Hi-C
2025-09-01
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