LaTeX化学公式

本文介绍了如何使用LaTeX的chemfig包来创建化学公式,包括线性结构、定义角度、绘制环形结构、连接环和分支。示例代码展示了不同类型的连接、自定义公式样式和创建复杂分子结构的方法。

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LaTeX化学公式

原  文:Chemistry Formulae
译  者:Xovee
翻译时间:2023年7月14日

在LaTeX中,我们可以使用一些包来创建化学公式,例如:chemfig, ochem, streetexxymtex等。最直观的包可能就是chemfig包了。本文介绍如何使用chemfig包来在LaTeX中创建化学公式。

介绍

创建一个分子结构图(molecule)主要包括用线来链接不同的原子团(atoms group)。一个简单的线性公式可以由以下代码绘制:

\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}
\begin{document}

\section{Introduction}
Writing chemical formulae with chemfig is straightforward.

\chemfig{A=B}
\end{document}

输出:
在这里插入图片描述
我们首先在文档的开头引入chemfig包。命令\chemfig{A=B}绘制了分子。符号=定义了连接的类型。文末列出了常见的连接类型。

角度(Angles)

我们可以使用多种方法来定义分子结构中连接之间的角度。

To define chemical formulae you can use units that define the angles

\chemfig{A-[1]B-[7]C}

Absolute angles

\chemfig{A-[:50]B-[:-25]C}

Relative angles

\chemfig{A-[::50]B-[::-25]C}

输出:
在这里插入图片描述
在上面的例子中,我们使用了三种不同的定义角度的命令。

  • default units:命令\chemfig{A-[1]B-[7]C}中,方括号中的参数设定了角度。每个单位的值等于45°。因此,在这个例子中,角度的值是45°和315°。
  • absolute units:我们也可以使用绝对单位,在命令\chemfig{A-[:50]B-[:-25]C}中,方括号中的参数直接表示角度(从水平线开始衡量),并且我们可以使用值为负数的角度。
  • relative angles:在第三个例子中,即命令\chemfig{A-[::50]B-[::-25]C},我们设定的角度值是相对于之前的角度的。

环 Rings

下面的例子介绍了如何绘制多边形:

Regular polygons:

\chemfig{A*5(-B=C-D-E=)}

Incomplete rings are also possible:

\chemfig{A*5(-B=C-D)}

输出:
在这里插入图片描述
命令\chemfig{A*5(-B=C-D-E=)}的语法:

  • A:第一个原子,剩下的原子们将会从这里开始绘制
  • *5:多边形的边数
  • (-B=C-D-E=):剩下的原子和连接(bond)。如果它们的数目加一小于多边形的边数,那么命令将会绘制一个不完整的环。

我们还可以传递一个额外的参数:两个星号(**)。例如,如果我们使用**5而不是*5,那么在多边形之内将会绘制一个圆圈(circle)。

连接环(Connected Rings)

下面的例子绘制了一个咖啡因的化学结构:

\documentclass{article}
\usepackage{chemfig}
\begin{document}
\section{I need caffeine.}

\chemfig{*6((=O)-N(-H)-(*5(-N=-N(-H)-))=-(=O)-N(-H)-)}
\end{document}

输出:
在这里插入图片描述

分支 Branches

化学公式并不都是线性的,分支公式其实才是最常见的类型。请看下面的例子:

Branched molecule \vspace{.5cm}

\chemfig{H-C(-[2]H)(-[6]H)-C(=[1]O)-[7]H}

输出:
在这里插入图片描述
每个节点的分支由括号及其参数所创建。例如,代码

C(-[2]H)(-[6]H)

创建了两个C的分支,角度分别为2个单位(90°)和6个单位(270°)。

分支还可以添加到环中:

Branched ring
\vspace{.5cm}

\chemfig{A*6(-B=C(-CH_3)-D-E-F(=G)=)}

输出:
在这里插入图片描述
语法是类似的,使用小括号来给原子添加分支。例如F(=G)的含义是给节点F添加一个分支G。我们还可以使用嵌套来创建更复杂的例子。

自定义公式

我们还可以自定义化学公式的颜色和节点间距等参数,以及添加公式的描述文字。

{\huge 
    \setchemfig{atom sep=2em,bond style={line width=1pt,red,dash pattern=on 2pt off 2pt}}  
    \chemname
    {\chemfig{H-C(-[2]H)(-[6]H)-C(=[1]O)-[7]H}}    
    {Acetaldehyde}
}

输出:
在这里插入图片描述
我们使用了三个新的命令:

  • \setbondstyle{ }:在大括号中我们可以传递多个样式命令
  • \setatomstep{2em}:设置原子之间的间距为2em。你也可以使用其他的距离单位。
  • \chemname{}{}:第一个参数是chemfig公式,第二个参数是公式下所显示的文字。在这个例子中,显示的文字是Acetaldehyde。

我们使用的字体大小为huge。你也可以使用其他的字体大小,公式的大小也会随之发生改变。

参考指南

连接类型

连接类型代码输出
single\chemfig{O-H}在这里插入图片描述
double\chemfig{O=H}在这里插入图片描述
triple\chemfig{O~H}在这里插入图片描述
plain right cram\chemfig{O>H}在这里插入图片描述
plain left cram\chemfig{O<H}在这里插入图片描述
dashed right cram\chemfig{O>:H}在这里插入图片描述
dashed left cram\chemfig{O<:H}在这里插入图片描述
hollow right cram\chemfig{O>|H}在这里插入图片描述
hollow left cram\chemfig{O<|H}在这里插入图片描述

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