Annotation的基本使用

    三种内定的Annotation

1,@Override    声明方法是重写的

2,@Deprecated    声明已过时的方法或类

3,@SuppressWarnings   压制警告信息,里面可以是数组类型,{deprecation,unchecked,fallthrough,path,serial,finnally,all}

 

自定义Annotation

@Documented //文档注释
@Inherited //继承的类也继承注解
@Target(value={ElementType.TYPE,ElementType.METHOD,ElementType.FIELD}) //设置注解作用的地方,type为类
@Retention(RetentionPolicy.RUNTIME) //指定在运行时也起作用
public @interface TestAnno {
 public String value() default "aa";
 public int key() default 1;
 public my tt() default my.asd;
}

 

可以通过反射机制调用

Class<?> class1=Class.forName("com.bean.Student");
  @SuppressWarnings("all")
  Method method=class1.getMethod("say", null);
  Annotation[] annotations=method.getAnnotations();
  for (Annotation annotation : annotations) {
   
   if(annotation instanceof TestAnno){
    TestAnno ts=(TestAnno)annotation;
    System.out.println(ts.key());
   }
   
   
  }

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KEGG Automatic Annotation Server (KAAS) 是一种基于KEGG数据库的自动注释工具,可以将输入的基因序列与KEGG数据库中的已知功能进行比对,从而预测基因的功能。 以下是使用KAAS的详细步骤: 步骤1:进入KAAS网站 打开网址:https://www.genome.jp/kaas-bin/kaas_main,进入KAAS网站。 步骤2:上传数据 点击网页中的“Upload file”按钮,选择需要进行注释的基因序列文件,支持FASTA格式,文件大小不得超过10MB。 步骤3:设置参数 在“Options”栏中,选择需要进行注释的物种和注释方式,可以选择“single-directional best hit”或“bi-directional best hit”两种方式。此外,还可以选择是否进行KEGG Orthology (KO) enrichment分析。 步骤4:提交任务 点击“Submit”按钮,将任务提交给KAAS服务器进行处理。处理时间根据数据量大小而定,一般在几分钟到几小时之间。 步骤5:获取结果 处理完成后,可以在网页中查看注释结果。结果包括注释的KO号、KEGG通路、KEGG反应、KEGG模块等信息。此外,还可以下载注释结果文件,支持多种格式,如文本文件、Excel文件和图片文件等。 注意事项: 1. KAAS只能对已有注释的物种进行注释,对于未知物种或未知基因的注释效果可能不佳。 2. KAAS注释结果仅供参考,仍需进行实验验证。 3. 在使用KAAS时,需要了解KEGG数据库的基本知识,如KEGG通路、KEGG反应、KEGG模块等。
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