POJ 1080 基因序列相似度计算 动态规划

通过动态规划计算两个基因序列s1和s2的相似度,d[i][j]表示取s1的第i个字符和s2的第j个字符时的最大分值。考虑三种情况:1. s1取第i个,s2空;2. s2取第j个,s1空;3. s1和s2都取对应字符。dp[i][j]为这三种情况的最大值。注意初始化p数组和边界值d[0][j]、d[i][0]、d[0][0]的赋值,否则可能导致错误。
摘要由CSDN通过智能技术生成
 本题为典型的动态规划,关键找出序列比对的3个不同情况,即子问题

设d[i][j]为取s1第i个字符,s2第j个字符时的最大分值

则决定p为最优的情况有三种 p数组为分数矩阵

1、  s1取第i个字母,s2取“ - ”: d[i-1][j]+p[ s1[i-1] ]['-'];

2、  s1取“ - ”,s2取第j个字母:d[i][j-1]+p['-'][ s2[j-1] ];

3、  s1取第i个字母,s2取第j个字母:d[i-1][j-1]+p[ s1[i-1] ][ s2[j-1] ];

 即dp[i][j]为上述三种情况的最大值

易犯错误

1、p数组的初始化,不细心的话容易犯错(因为这个低级错误WA两次- -)

2、d[0][j],d[i][0],d[0][0]边界值的赋值

Source Code

Problem: 1080   User: yangliuACMer
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