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原创 安装IMvigor210CoreBiologies R包遇到的一系列问题

安装IMvigor210CoreBiologies R包遇到的一系列问题IMvigor210CoreBiologies 是非常经典的免疫治疗队列的数据包,课题需要所以必须下载安装IMvigor210CoreBiologies 是非常经典的免疫治疗队列的数据包,课题需要所以必须下载安装官方给出的安装步骤已经过时了,参考生信技能树的安装步骤,首先安装了一堆依赖包。list.of.packages <- c("shiny", "tidyr", 'tidyverse', "clusterProf

2022-02-25 20:40:17 3052 8

原创 小白的安卓前端开发,记录那些无解的坑(持续更新)

背景从生物工程转到生物信息学,再因为导师项目需求着手开发物联网android 客户端,我这一路经历了无数大大小小的坑,有的解决了但因为没有记录所以也就忘了怎么解决的,有的通过各种途径都没办法debug后来因为对项目发展影响不大也就忘了。这显然不是一个好习惯,不能很好地从坑里得到成长,因此开了此贴以记录这一次安卓开发的大大小小的坑,希望自己能坚持住!同时也希望看到此贴的大佬们能够在评论区指点一二!感谢!前端的开发采用Android Studio集成环境,编程语言为Kotlin难到我的bugsFrag

2020-11-18 11:40:55 234

转载 统计学之置换检验

我们一般平时较为常用的检验要属有参检验,但是其要求样本必须满足近似正态,无离群点,数据量大等要求;而有些时候其实很难都满足以上前提条件,则这时需要使用无参检验,其只关注数据的秩,但是无参检验有时也无法处理一些样本数较少的情况,这时则可以使用置换检验 置换检验,是Fisher提出的一种基于大量计算(computationally intensive),利用样本数据的随机排列(置换检验的核心思想,故名Permutation test),进行统计推断的方法。因其对总体分布自由,特别适合用于总体分布未知的小样本数

2020-08-27 16:20:13 1948

原创 鸟哥的linux私房菜 [Linux文件与目录管理]

一、处理目录的命令cd:切换目录 cd ~ :回到自己的主文件夹 cd .. : 返回上层目录 cd - :回到前一个工作目录 cd [相对路径或绝对路径] :进入路径所在文件夹pwd:显示当前目录 pwd -P:显示当前目录完整路径,而非连接文件的路径mkdir:新建一个新的目录 -m, --mode=权限分数(eg:777),类似 chmod,而不是...

2019-10-10 11:49:17 117

原创 鸟哥的linux私房菜 [Linux的文件权限与目录配置]

Linux的文件权限与目录配置1、Linux中的角色(1)root拥有一切执行权力的天神,能够创建用户、删除用户、修改文件目录权限等(2)onwer用户个人,文件目录的所有者,只能对给定权限的文件及目录进行操作。每一个用户都有自己归属的组(group),用户组内的成员对某个文件拥有一致的权限(3)other其他人,其他人只有在root或用户设置的一定权限下进行操作2、如何查看文件属...

2019-09-26 17:40:51 154

原创 鸟哥的linux私房菜 [在线求助man page]

鸟哥的linux私房菜自学手册开始执行命令1、[用户名@主机名前三位]$ 命令 选项 参数…2、自己的主文件夹用~表示3、大小写区分清楚4、无论多少空格仅当一个空格处理5、输入命令之后显示结果为乱码,可调试[vbird@www~]$ echo $LANGzh_CN.UTF-8[vbird@www~]$ LANG=en_US基础命令的操作1、date2、cal3、bc重...

2019-09-17 18:38:34 117

原创 [Day 4] 基本数据管理

基本数据管理1、导入一个例子2、创建新变量再典型的研究项目中,需要创建新变量或对现有变量进行变换,通过变量名<-表达式语句来完成,但要注意的一点是,表达式中的数据要指明来源否则会报错,指明来源的方式有以下三种,推荐使用transform()函数。mydata<-data.frame(x1=c(2,2,6,4),x2=c(3,4,2,8))mydata$sumx<-my...

2019-04-28 15:48:17 204

原创 [Day 3] R in action (图形初阶)

感冒发烧了三天,也是没有精力的三天,满满的罪恶感。马上回到学习频道!图形初阶图形的创建和保存1、使用图形以mtcars为例说明图形的创建和保存。要通过代码保存图形,将绘图语句夹在开启目标图形设备的语句(pdf(),jpeg(),bmp()…)和关闭目标图形设备的语句之间就可以了。pdf('mygraph.pdf')attach(mtcars)plot(wt,mpg)abline(...

2019-04-26 10:38:31 261

原创 [Day 2] R in action 学习笔记(创建数据集)

探索R中的数据结构 数据集通常是由数据构成的一个矩形数组,行表示观测,列表示变量。统计学:观测-变量数据库分析:统计学。统计学家称它们为观测(observation)和变量 (variable),数据库分析师则称其为记录(record)和字段(field),数据挖掘/机器学习学科的研 究者则把它们叫做示例(example)和属性(attribute)。R的数...

2019-04-22 15:26:48 209

原创 [Day1] R in reaction 学习笔记(环境配置)

环境配置1、R及Rstudio下载R是一门解释性语言,不同于python,可以逐行运行脚本文件,且严格辨别大小写字母。Rstudio至于R,相当于Pycharm之于python,是R语言的集成开发环境,提供清晰的界面和包的管理等便利之处。2、R包的下载和使用 install.packages('ggplot2') #下载安装ggplot2包 l...

2019-04-21 10:39:52 236

原创 [Day7] python 集训

[Day 7]【作业构想】啥是佩琪复现# -*- coding:utf-8 -*-from turtle import*def nose(x,y):#鼻子 penup()#提起笔 goto(x,y)#定位 pendown()#落笔,开始画 setheading(-30)#将乌龟的方向设置为to_angle/为数字(0-东、90-北、180-西、270-...

2019-02-01 10:46:15 143

原创 [Day6] python 集训

【Day 6】函数关键字(1)defdef greet_user(username):#username为形参 '''显示简单的问候语''' print('hello,' + username.title()+'!')greet_user('penny')#penny为实参#输出结果hello,Penny!def display_message(message)...

2019-01-31 15:44:57 129

翻译 [Day 5] python集训

【Day 5】1.正则表达式re正则表达式是用于描述一组字符串特征的模式,用来匹配特定的字符串。通过特殊字符+普通字符来进行模式描述,从而达到文本匹配的目的的工具。2.os模块Python的标准库中的os模块主要涉及普遍的操作系统功能。可以在Linux和Windows下运行,与平台无关。os.sep 可以取代操作系统特定的路径分割符。os.name字符串指示你正在使用的平台。比如对于W...

2019-01-30 21:52:21 159

翻译 [Day4]python集训

[Day4]1.判断语句(if-elif语句)编程时经常需要检查一系列条件,并据此决定采取什么措施。在Python中,if 语句让你能够检查程序的当前状态,并据此采取相应的措施。1.1 判别元素是否在列表中nums=[1,2,3,4,5,6]if 1 in nums: print('1 is in nums')else: print('1 is not in nums') #...

2019-01-29 20:11:20 322

原创 [Day3]python 集训

[Day3]1.dict字典1.1 定义字典 是一系列 键 — 值对 。每个 键 都与一个值相关联,你可以使用键来访问与之相关联的值。与键相关联的值可以是数字、字符串、列表乃至字典。1.2 创立alien_0={&quot;color&quot;:&quot;red&quot;,&quot;point&quot;:2}print(alien_0)#输出结果{'color': 'red', 'point': 2}1.3 字

2019-01-28 21:21:40 127

原创 [Day2]python集训

【Day 2】基础1.1 列表定义: 由一系列按特定顺序排列的元素组成。1.2 标志–[]1.3 基本操作(1)创建bicycles = ['trek', 'cannondale', 'redline', 'specialized']print(bicycles)#输出结果['trek', 'cannondale', 'redline', 'specialized'](...

2019-01-27 16:26:46 146 1

原创 [Day1] python集训

【Day1】1.python 基础讲解1.1.1 python变量特性&amp;amp;gt;&amp;amp;gt;&amp;amp;gt; message=&amp;quot;hello python world!&amp;quot;&amp;amp;gt;&amp;amp;gt;&amp;amp;gt; print(message)hello python world!&amp;amp;gt;&

2019-01-26 16:31:33 222 5

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