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原创 用Python的mat73包 加载 MATLAB的mat文件
如果保存的mat文件是”v7.3“格式,这时用Python加载该mat文件,就不能用scipy了,要用Python的mat73包来加载。
2022-08-15 09:33:13 2470 1
原创 GCN学习资源
一、源码作者Thomas Kipf大神Github主页提供了Pytorch版本源码:https://github.com/tkipf/pygcn;他著名的那篇开山论文《Semi-Supervised Classification with Graph Convolutional Networks》,在论文里面提供了TensorFlow的源码。二、牛B哄哄的学习链接1.pygcn源码注释 - 知乎(墙裂推荐!作者对每句代码都加了注释,非常适合初学者)2.pygcn代码解析 - 知乎(也很详
2022-05-24 09:23:24 207
原创 打maker,分段,提epoch的基本操作
对于脑电EEG数据,在进行功能连接计算之前,要充分做好预处理步骤。这里仅把打marker,分段,提epoch的基本操作做个笔记。首先,打marker和events数量有关;分段和epoch数量有关(eeglab中可以看到相应信息);打完marker,分完段并且做好所有的预处理步骤后,就可以提epoch了,提epoch是为了对不同数据中的不同多个epoch取个统一数量(比如1.set有1010个epoch,2.set有990个epoch,3.set有880个epoch,就可以把这仨全部取成800个ep..
2022-05-14 16:19:07 7257 3
原创 用MNE包进行Python脑电数据处理
代码来自公众号“路同学”。这里仅仅把路同学总结的文档里面的代码挑出来了而已。为了方便想先试用一下MNE进行脑电预处理的友友。这里加载的数据集是你的eeglab里面的sample data。'''step1:读取数据step2:滤波step3:去伪迹step4:重参考step5:分段step6:叠加平均step7:时频分析step8:提取数据'''# MNE # 导入原始数据import numpy as npimport mneimport pymatreade
2022-05-08 21:46:19 6131 2
原创 复杂脑网络之图论参数计算(BCT工具包)
以下内容一定漏洞百出[求饶.jpg]...作为渣渣小白,一点一点摸索怎么使用BCT工具包,目前只会计算几个参数,原理神马的也没太明白呢。接下来的任务就是从原理公式入手,再对逐个参数的计算代码进行理解...所以内容会不断改进和补充。有错误请尽管指出,感谢~一、计算聚类系数、特征路径长度、小世界参数大概思路:功能连接矩阵---去除虚假连接的矩阵---加权矩阵---计算图论参数1. 功能连接矩阵---去除虚假连接的矩阵首先,拿出你计算过功能连接的矩阵,再根据计算功能连接的指标说明进行“筛选”。比如
2022-04-13 22:34:09 9408 38
原创 脚本实现脑电数据预处理后的.set文件转换为HERMES工具包可读取的.mat文件
脑电数据经过eeglab预处理后生成.set格式数据,而HERMES工具包一般只能读取.mat格式的数据,所以就可以用一段脚本实现格式的转换。代码来自VX公众号“茗创科技”分享。首先,把要转换的.set文件放在一个文件夹下面,我把要转换的.set文件放在了一个文件夹下:把下面的 set2mat.m 脚本放在项目文件夹下,用MATLAB打开这个脚本并设置好当前路径:clc;clear all; close all;%% 指定相关信息Data_Dir = uigetdir([..
2022-04-11 15:19:19 4586 31
空空如也
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