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RSS订阅原创 【编程练习】RNA序列翻译成蛋白质
给定：氨基酸密码子表，和一个保存多条RNA序列的Fasta文件任务：得到RNA序列翻译得到的氨基酸序列，保存为Fasta文件。
2023-06-04 16:29:29
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原创 【报错解决】UserWarning： Selected implementation cpp is not available.
运行程序的时候有警示信息，但并不影响程序的执行。根据信息搜索不到有用的解决问题的信息。
2023-05-31 15:48:39
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原创 【报错解决】AttributeError module ‘lib‘ has no attribute ‘OpenSSL_add_all_algorithms‘
报错原因是 cryptography 和 pyopenssl 两个模块之间不兼容导致，解决方法是降低cryptography的版本。
2023-05-31 14:04:52
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原创 变异检测准确性评估软件 RTG-tools 使用
RTG vcfeval在单倍型水平上执行变异比较，也就是确定在应用于参考基因组时，比较的VCF中鉴定的基因型是否导致相同的基因组序列。迄今为止，没有其他工具能够像RTG vcfeval一样准确且快速地执行此分析。RTG vcfeval输出包含比较结果、摘要指标和ROC曲线数据文件的VCF文件。
2023-04-20 14:56:46
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原创 检测和估计样本间 DNA 污染-VerifyBamID2
提供 VCF 和基因组 FASTA 文件即可制作自己的资源文件进行鉴定污染，这个方法适合于靶向测序数据，因为检测的突变位点比较少，不适合使用作者提供的 100k 和 10k 突变位点的资源文件。提取vcf建议从 1000g phase3 数据库中提取。for i in {1000g phase3 数据下载地址：https://hgdownload.cse.ucsc.edu/gbdb/hg19/1000Genomes/phase3/2. 合并vcf。
2023-04-17 14:08:04
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空空如也
空空如也
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