解决绘制theano图形时出现的`Runtime Error: Failed to import pydot’错误

错误信息

当我在练习theano官方例程时，遇到的一个错误。

根据报错信息，可以判断出在代码执行pydotprint函数时需要依赖pydot和graphviz的python模块。但是，我使用pip list查看，发现已经安装了pydot和graphviz的程序包。单独执行“import pydot”时也没有报错。这让我很困惑。

分析错误

于是，我开始在网上google错误信息。在github的一个issue中，我找到了线索。虽然之前安装了graphviz的python 模块，但是此模块只是一个python接口，其核心库和程序并没有随着一起安装，需要从Graphviz的网站上下载对应的安装文件安装，这在graphviz模块所在的pypi上也有说明，只是之前被忽略了。

To render the generated DOT source code, you also need to install Graphviz.
Make sure that the directory containing the dot executable is on your systems’ path.

解决方案

于是总结解决方案如下：
1. 安装c编译的Graphviz，并把bin文件夹所在的目录添加到系统环境变量PATH中
2. 使用pip安装pydot和graphviz
3. 验证pydot是否能够链接Graphviz的二进制文件

import pydot
print pydot.find_graphviz()

如果链接成功，则会打印类似如下的结果

绘制Theano Graph

该错误解决后就可以可视化theano的graph了。
执行如下的toy code：

import theano
a = theano.tensor.vector()
out = a + a**10
f = theano.function([a], out)
theano.printing.pydotprint(f, outfile = “f_optimized.png”, var_with_name_simple = True)

然后就可得到打印出的graph了。