解决R 3.6.0下rvcheck版本过高导致安装clusterProfiler失败

yummy2009

已于 2022-02-22 17:20:05 修改

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分类专栏： R 文章标签： r语言

于 2022-02-18 10:13:41 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/yummy2009/article/details/122997379

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在R 3.6.0环境下安装clusterProfiler时遇到rvcheck版本过高导致的错误。rvcheck用于检查R版本，作者为避免用户使用过时版本而创建。解决方法包括安装特定版本的clusterProfiler，如3.16.0，这需要先升级BiocManager，并确保使用与BiocManager相匹配的R版本。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

> BiocManager::install("clusterProfiler")
Bioconductor version 3.10 (BiocManager 1.30.10), R 3.6.0 (2019-04-26)


Error in get(name, envir = asNamespace(pkg), inherits = FALSE) : 
  object 'get_fun_from_pkg' not found

--
> packageVersion("rvcheck")
[1] ‘0.2.1’
> remotes::install_version("rvcheck", version="0.1.8")
These packages have more recent versions available.
It is recommended to update all of them.
Which would you like to update?

1: All                                    
2: CRAN packages only                     
3: None                                   
4: rlang       (0.4.10  -> 1.0.1  ) [CRAN]
5: BiocManager (1.30.10 -> 1.30.16) [CRAN]

Enter one or more numbers, or an empty line to skip updates: 3
* installing *source* package ‘rvcheck’ ...
** package ‘rvcheck’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** using staged installation
** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** he

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