jupyter notebook使用.py运行,报错 timeouterror cell execution timed out


# 默认一个cell30s,实际几个cell远超30s
https://juejin.cn/s/jupyter%20timeouterror%20cell%20execution%20timed%20out
# 1.增加超时时间:在Notebook中添加以下代码,可以将超时时间延长到更长的时间。例如,以下代码将超时时间设置为60秒。
# 2.优化代码:如果您的代码确实需要很长时间才能执行完毕,那么您可以尝试优化代码,使其更快执行。例如,使用更高效的算法或数据结构,避免使用嵌套循环等。
# 3.分割代码:如果您的代码太长,可以尝试将其分成多个部分并逐个执行,这样就可以避免超时的问题。

Preventing Jupyter timeout errors when running notebooks as a batch/scheduled job

https://github.com/executablebooks/jupyter-book/issues/613

https://github.com/executablebooks/jupyter-book/issues/945

https://github.com/executablebooks/jupyter-cache/issues/39

https://github.com/ipython/ipython/issues/8382

# The timeout is configurable. 
# Set c.ExecutePreprocessor.timeout in the config file, 
# or pass --ExecutePreprocessor.timeout=180 at the command line.


# import signal
# from contextlib import contextmanager

# @contextmanager
# def time_limit(seconds):
#     def signal_handler(signum, frame):
#         raise TimeoutError("Time's up!")
    
#     signal.signal(signal.SIGALRM, signal_handler)
#     signal.alarm(seconds)

#     try:
#         yield
#     finally:
#         signal.alarm(0)
        
# %%time
# with time_limit(300):
#     time.sleep(20)
#     # your code here
 

Jupyter Notebook 提供了一个交互式的环境,用于编写和运行 Python、R、Julia 等多种语言的代码。用户可以在同一个文档中同时编辑文本、代码和可视化结果。 要运行 Jupyter Notebook 中的所有单元格,你可以按照以下步骤操作: ### 手动运行全部单元格 1. **点击每个单元格**:在 Jupyter Notebook 的界面中,每个单元格都有一个执行按钮(绿色三角形)。你需要依次单击并执行每个单元格。 - 双击单元格会进入编辑模式,你可以在此输入或修改代码。 2. **批量运行单元格**:如果你不想逐个点击每个单元格,可以使用快捷键`Shift + Enter`快速运行当前单元格,并自动向下滚动到下一个单元格进行执行。 ### 自动运行所有单元格 对于自动化运行所有单元格的情况,通常是在脚本中执行特定操作。这涉及到编程技巧而非直接操作 Jupyter Notebook 的 UI 操作。例如,可以创建一个函数或脚本来遍历所有单元格并执行它们。这里提供一种简单的示例脚本: ```python # 导入所需的库 import IPython.core.magic as magic def run_all(): # 获取所有单元格对象 cells = [] def add_cell(cell): if cell.cell_type == 'code': cells.append(cell) # 遍历所有单元格并添加到列表中 magic.execute('for c in get_ipython().execution_manager.cells.values():') for c in get_ipython().execute_input('add_cell(c)', store_history=False)['outputs']: add_cell(c['cell']) # 执行所有的单元格 for cell in cells: magic.execute(f"get_ipython().run_cell(cell)") ``` 请注意,上述代码段需要特定的环境和许可才能正常工作,且可能在某些环境中不可用。此外,它涉及了对 Jupyter 内部 API 的操作,可能并不适用于所有版本的 Jupyter Notebook 或者受到安全限制。 ### 相关问题: 1. 如何调整 Jupyter Notebook 单元格执行顺序? 2. Jupyter Notebook 是否支持其他编程语言? 如果支持,如何切换? 3. Jupyter Notebook 能否保存运行过程中的数据及可视化结果?
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