R语言使用cph函数和rcs函数构建限制性立方样条cox回归模型、使用rms包的Predict函数计算指定连续变量在不同分组变量下和风险比HR值的关系、使用ggplot2可视化变量与风险值HR的关系

最新推荐文章于 2023-06-13 09:32:55 发布
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分类专栏： R语言从入门到机器学习 文章标签： 数据挖掘 人工智能 机器学习 数据分析 r语言
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R语言使用cph函数和rcs函数构建限制性立方样条cox回归模型、使用rms包的Predict函数计算指定连续变量在不同分组变量下和风险比HR值的关系、使用ggplot2可视化连续变量在不同分组变量下和风险值HR的关系、美化可视化图像

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rms:这是CRAN R软件包系统信息库的只读镜像。 rms —回归建模策略。主页
03-18
均方根 回归建模策略 当前目标 为贝叶斯偏比例比值模型blrm函数实现估计和预测方法 网站 总体： ： 书籍： ： CRAN： ： 变更日志： : 去做 修复survplot，以便显式命名的Adjust-to值仍在字幕中。参见tests / cph2.s。 将fit.mult.impute固定为平均sigma ^ 2，然后取平方根，而不是对sigma取平均值 在psm中实现用户添加的分发-请参阅
基于rms包的限制性立方样条回归（RCS）R代码实现
2301_79584199的博客
10-16 5504
RCS
R实战 | 限制性立方样条(RCS)
weixin_45822007的博客
08-15 1万+
RCS在科学研究中，我们经常构建回归模型来分析自变量和因变量之间的关系。大多数的回归模型有一个重要的假设就是自变量和因变量呈线性关联。当自变量和因变量之间为非线性关系时，可以将连续型变量转化为分类变量，但是分类变量的类别数目以及节点位置的选择一般会带有主观性并且分类变量会损失部分信息；也可以直接拟合自变量和因变量之间的非线性关系，但是直接构建多项式回归可能存在过度拟合、共线性等问题。因此，一个更好...
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R语言随手笔记
FanJin的博客
11-22 1万+
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dege857的博客
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上图只显示了一部分，这是一个转移性胃癌患者（Power、Capanu、Kelsen 和 Shah 2011）的数据（公众号回复：胃癌数据，可以获得数据），数据很多我们选取一部分建模，age_dx：年龄，group：分组变量，分为存活率小于2年的和大于两年的，inv_weight：概率权重，ssize：每个分组患者的人数，survival生存时间，surv_cens生存结局。prob 指定的抽样概率对于长期幸存者组（≥ 24月）中的患者等于 1，对于存活不到 2 年的患者均等于 253/853=0.296。
R语言rms包生存分析之限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析详解实战:拟合连续性自变量和事件风险之间的关系：基于survival包lung数据
data+scenario+science+insight
10-01 4833
R语言生存分析之限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析详解实战:拟合连续性自变量和事件风险之间的关系：基于survival包lung数据 目录 R语言生存分析之限制性立方样条(RCS, Restricted cubic spline)分析详解实战:拟合连续性自变量和事件风险之间的关系：基于survival包lung数据 #限制性立方样条图（Restricted cubic spline，RCS） #导入包和数据 #数据格式转换 #cox比例风险模型构.
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03-04
VBA回调 Microsoft Access VBA中的回调函数 版本1.2.0 （c）Gustav Brock，仙人掌数据ApS，CPH Microsoft Access鲜为人知的功能 回调函数是Microsoft Access中的隐藏元素。... 您还可以使用用户定义的函数设置Ro
使用burp-cph插件对对动态参数爆破1
08-03
作者：天启 @涂鸦智能安全实验室0x01 背景某天我像往常样渗透着站，但是遇到下这样的个场景，有个登陆框如图 1 所示，没有验证码，我使 burpsuite 抓
idris-cph-exercises:3月11日至15日在国际电联哥本哈根会议上发表的Idris演讲系列的练习，已更新以与最新的Idris版本配合使用
05-10
idris-cph练习 2013年3月，在有关系列讲座。 该项目采用了原始的演讲练习，并对其进行了更新以与Idris最新发行版一起使用。 第一讲：简介 讲座二嵌入式DSL 第三讲效果管理 第四讲实现Idris 可以在和在线找到更多...
使对竞争性编程的判断、编译和下载问题变得容易。- agrawal-d / cph
01-27
Competitive Programming Helper (cph) This extension allows you to quickly compile, run and judge competitive programming problems from within VS Code. You can automatically download testcases write & ...
R语言限制性立方样条回归
医学和生信笔记的博客
01-11 6281
前面用了2篇推文，帮大家梳理了的常用方法，包括今天主要介绍R语言实现。读过上面几篇推文的朋友想必已经知道了（没看过的建议先看看），样条回归包括很多种，限制性立方样条只是其中一种，更多的大家可以自己了解。
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statistics+insight+vista+power
06-12 585
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04-13 1445
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04-12 1223
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首发： ggrcs包，一个用于绘制直方图+限制立方样条+双坐标轴图的R包
dege857的博客
08-16 3356
Fit就是你的模型，目前只支持cox回归和logistic回归，因为依托于RMS包的rcs函数支持，所以模型的格式是lrm和cph，等下我会演示怎么操作。Histbinwidth直方图宽度，默认是0.8，histcol直方图颜色，默认是绿色，linetype：RCS的线型，linesize：RCS的线条大小，忘记加入调整线颜色的函数了，后期改进。Ribalpha:可信区间透明度，ribcol可信区间颜色，默认是红色，xlab，ylabX轴和Y轴的标签，title标题。柱子很稀疏，不够美观，增加柱子宽度。..
r软件的rms程序包(version 6.2.0)使 用限制性立方样条cox比例风险回归模型分析在
最新发布
11-07
R软件的rms程序包(version 6.2.0)可以通过使用限制性立方样条Cox比例风险回归模型来进行分析。 Cox比例风险回归模型是一种常见的生存分析方法，用于研究与时间相关的事件发生率和相关因素之间的关系。它适用于分析生存时间数据，如存活时间、事件发生时间等。 限制性立方样条是一种用于建模非线性关系的统计方法。它通过将连续自变量拟合成一系列非线性分段函数，以更好地适应数据的非线性关系。这个方法在生存分析中非常有用，因为生存时间与相关因素之间的关系往往是复杂的，无法用简单的线性关系描述。 rms程序包为R软件提供了方便的工具来执行限制性立方样条Cox比例风险回归模型分析。它包括了一系列函数和工具，可以用于数据的预处理、模型的建立和评估等步骤。 在使用rms程序包进行分析时，我们可以首先导入需要的数据，并进行必要的数据预处理，如缺失值处理和变量转换等。然后，我们可以使用rcs函数来创建限制性立方样条变量，将连续自变量转化为分段函数形式。接下来，可以使用cph函数来拟合Cox比例风险回归模型，并进行模型的评估和推断，如检验模型的合理性和进行变量选择等。最后，可以通过使用summary函数和plot函数来查看模型的结果和进行可视化分析。 总之，rms程序包的限制性立方样条Cox比例风险回归模型分析功能在R软件中提供了一个强大的工具，可用于研究生存时间数据与相关因素之间的关系，并得出有关事件风险的有用结论。

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