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原创 UMLS—记录一些使用

UMLS参考手册https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK9676/MetaMapMetaMap是一个把生物医学文本与UMLS超级词表中的概念匹配起来的程序MetaMap下载(需要UMLS许可):Main Downloadhttps://lhncbc.nlm.nih.gov/ii/tools/MetaMap/run-locally/MainDownload.html官网上的安装教程:Installation - MetaMaphttps://lh

2021-12-17 15:11:24 2202 2

原创 ModuleNotFoundError: No module named ‘pytest‘

用pycharm连接服务器运行代码的时候,明明安装了pytest却仍然报错。而且,是要运行带test函数的时候报错。查看pycharm会发现,用的python test解析器。把他从里面移除,在上面的python导入想要运行的。能暂时解决这个问题。之前博客看到还有一种解决方法暂时想不起来了。等想起来再更新。...

2021-12-06 20:33:19 264

原创 2021AAAI | 嵌套命名实体识别

Nested Named Entity Recognition with Partially-Observed TreeCRFs(作者:英国爱丁堡大学和阿里巴巴)传统的序列标记的方法已经不适合用来识别嵌套实体。在这篇文章中,作者使用了partially-observed TreeCRFs(PO-TreeCRFs),将标记的实体跨度看作树中的可见节点,将其他的看作潜在节点,与其他实体部分重叠的就reject(因为嵌套实体是完全嵌套的,不会部分重叠)。为了提高速度,作者还用了Masked Inside.

2021-05-18 11:32:05 2837

原创 一位经常上服务器,又干不了啥的Linux常用命令

记录一下经常用到的Linux命令1、实时查看GPU使用情况watch -n 1 nvidia-smi2、有conda的情况查看、创建、激活、删除虚拟环境//查看condaenvlist//创建(命名要规范,“-”是不行的,“_”才可以condacreate-nenv_namepython=x.x //命令参数说明:env_name,虚拟环境名称;x.x,Python版本//删除虚拟环境condaremove-nenv_name--all/...

2021-04-19 21:09:14 151

原创 记录第一次跑Multi-Grained-NER-master代码的成长历程

距离拿到这个代码到写下这篇博客已经过去三周有余了。我因为一样Allennlp版本刚好更新,然后装的最新版的。这个文章的代码总是跑不起来,现在各种搜索,终于跨出了一步。第一次听到博士师兄说Allennlp文档更新了,我就没想太多,而且之前喜欢什么都安装最新的,所以就在python==3.8,tensorflow==2.3.1,torch==1.7。0,allennlp==1.2.0这几个最新的版本上一直钻研琢磨。我找了很多查找方式,比如搜索allennlp的用法,elmo embedding,等等,去

2020-11-05 21:23:09 177

原创 出现AttributeError: module ‘typing‘ has no attribute ‘_ClassVar‘错误

在Ubuntu中使用allennlp -h的时候出现解决办法 pip uninstalldataclasses。然后就成功了

2020-11-03 19:52:17 9636 6

原创 Windows10下的MySQL安装教程

自己上网查看安装MySQL教程,总会出现一些毛病,而且我需要看图才能安装;在别人的指导下重新安装了一遍,并截下了所有图,所以想把整个过程分享一下1、首先去MySQL官网上下载最新的适合Windows10的安装程序下载地址2、下载完成后双击运行3、会出现这个界面,选取最后一个:custom,然后next(如果这里选server的话,就只能存数据,jdbc连不上)4、接下来...

2019-03-15 00:04:53 440 1

原创 red hat x86_64 yum替换成centos的yum及出现的部分问题

1、首先用rpm qa|grep yum检查是否安装过yum包2、若安装过,则用rpm qa|grep yum|xargs rpm -e --nodeps不检查依赖,直接删除rpm包,在用第一步骤命令查看是否卸载完成3、在http://mirrors.163.com/centos/6/os/x84_64/Packges中找到以下安装包:python-iniparse...

2018-10-12 18:00:42 180

空空如也

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