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RSS订阅原创 ImageJ批量计算叶片面积
这一步是把图片中的直尺P掉，如下图中的黄色方框区域)→Duplicate(在Image中，这一步相当于提取黄色区域部分)→Threshold(Image，adjust里面。如下图，调整两个水平滑动块，使图片中的叶片变成红色（这里的代码是setThreshold（1，200））。这里将要处理的图片放在一个文件夹里，再新建一个空文件夹用来放处理之后的照片（也就是变红的照片），最后点process就开始进行批量处理了。1先点直线→2在直尺上画出1cm的长度→3点analyze。将record框中的代码复制下来。
2023-08-20 20:51:11
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原创 ggplot2中的scale
我们上篇文章介绍的是ggplot2中的theme函数，主要用于调整图片主题，简单来说就是调整图中一些元素的大小，字体，颜色等等，图中展示的内容是不会改变的。而今天介绍的scale函数则是用来调整图中的内容范围。引用王敏杰老师的话“标度（scale）是用于调整数据映射的图形属性。”可能我这么说还是显得比较模糊，那就先举个例子：p=ggplot(mtcars,aes(mpg,disp))+geom_point()p+scale_x_continuous(“MPG”,breaks = c(15,25,35
2021-08-15 16:12:24
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原创 R语言ggplot2中的theme函数
大家先来看看这幅图吧，今天想分享的内容就和它相关。本人刚开始用R画图的时候其实比较抵触，因为觉得R画图时有的小细节改起来很麻烦，不如Oringin来的直接。究其原因还是代码不熟悉，学的不够扎实。今天就来重新梳理一下思路，主要内容是ggplot2中的theme函数。这个theme函数主要的用途是调节图的主题，主题主要分为整幅图的（plot），坐标轴的（axis），图例的（legend），面板的（panel）和分面元素（facet）。其中经常用到的是坐标轴主题的修改，比如常见的坐标轴字体大小的修改。图里每一.
2021-08-12 16:40:51
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原创 【R语言学习笔记】之提取气候数据
今天来分享一下R语言提取气候数据。希望能对大家有所帮助,如果有错误请大家给我指出来，谢谢啦~工具：Rstudio，包：ncdf4，terra，raster数据来源：国家地球系统科学数据中心,数据格式为nc。大致过程：样地经纬度设置-数据转换-根据样点位置提取所需数据。library(terra)library(raster)library(ncdf4)样点坐标设置site <- c("A","B","C","D","E" )lon <- c(100.00,105.00,110
2021-07-06 16:49:18
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原创 【国内生态学研究机构介绍】之东北师大
东北师大的生态学为全国重点学科，他们的研究对象主要是草地，几乎没有老师是做森林这块的。所以今天的分享就稍微粗糙一点了。如果对草地感兴趣的同学可以去东北师大生科院官网看看。下面简单介绍几位老师：高英志老师，中科院植物所毕业。草地生态学/全球变化生态学。特别关注全球气候变化条件下草地地下生态学过程和地上/地下信号传导的研究，近期也特别关注农作物和牧草间套作的增产机制的研究。王德利老师，东北师大毕业。研究领域为草地生态学、系统及进化生态学。近些年在草地生物多样性、动-植物关系、营养级效应，以及全球气候变化等
2021-07-06 16:47:11
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原创 【国内生态学研究机构介绍系列】之北京大学
北京大学的生态学不用说了，那自然是很好的，毕竟有方院士坐镇嘛。我对北京大学的了解呢也不多，今天我们就一起来学习一下吧~首先肯定是讲讲方精云老师了，知道方老师当然是因为他是院士，印象深刻的还有18年在PNAS上发了好几篇文章，然后现在还是云大校长。今天呢，我想了解一下不一样的东西，我想知道他的学生（博士）现在都在干嘛，他的研究方向啥的大家就自己去百度吧。表格中？表示没查到。说几个我知道的老师吧，唐志尧老师：去年评上杰青，做的是竞争作用对森林结构与功能的影响，之前在一次会议上听过唐老师的报告，我就不作评价了
2021-05-28 20:33:57
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原创 生态学研究机构之中山大学
大家好~今天向大家介绍一下中山大学生态学情况，目前该校的生态学学科被评为A+，我觉得是实至名归吧。我很早之前就了解到中大有两位德高望重的老前辈，张宏达老师（植物系统学、分类学、植物区系学和生态学）和王伯荪老师（亚热带森林生态学），在这我就不介绍了，因为作为小辈岂能用短短几行字就概括前辈们的一生，感兴趣的同学自己去了解一下吧。中大的生态学专业在生科院，今天发现竟然还有一个生态学院，于2018年成立，致力于生物多样性的形成与演化生物多样性的维持与保护、生态系统修复与功能提升、生态资源利用与绿色发展等领域。中大生
2021-05-06 22:15:26
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原创 简单粗暴的动态气泡图
R语言之动态气泡图刚开始学习R语言那会，被一个叫动态气泡图的图所吸引，因为看起来觉得很酷炫，当我把我的实验数据用动态气泡图展示给老师看的时候，我觉得他应该还是比较满意吧。为了画这个图，我记得是写了不下10行代码，用到了一个叫“animation”的包，当时这个包还得去Github上下载，除此之外还需要下载一个叫“magic”还是什么的软件。今天为什么想分享一下气泡动态图呢，是因为我见到一个包，画气泡图就几行代码，另外还有交互效果，是不是很厉害。我真的是感慨R语言发展的太快。OK，话不多说，下面开始介绍
2021-04-29 10:50:05
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空空如也
空空如也
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