[size=large]pyulbas 是对 boost ulbas 矩阵库的一个封装,同时可以方便的和numpy进行互操作
用法如下
import numpy
import pyublas
a = pyublas.zeros((5,5), flavor=pyublas.SparseBuildMatrix, dtype=float)
#SparseBuildMatrix是稀疏矩阵类型
#将第5行(行号从0开始),第2个元素赋值为19
a[4,2] = 19
#将第一行赋值为4
a[1]=4
#将a全部赋值为1
a[:]=1
#从a中切片出一个小矩阵
a[:3,:3]
#对a进行乘法运算,加,减类似
a=a*a
#可以添加一个小的块状矩阵
b = numpy.random.randn(2,2)
a.add_block(2, 2, b)
#打印出所有非0元素的位置和值
for i in a.indices():print i,a[i]
#a中非0元素的个数
print a.nnz
#对a中元素求和
print a.sum()
#array是什么意思???我没明白。。。也许array之后更快?
[color=orange]#更新,哦,我少看了一段:
"""
The SparseBuildMatrix flavor is designed for fastest possible assembly of sparse matrices, while the SparseExecuteMatrix flavor is made for the fastest possible matrix-vector product. There’s much more functionality here–don’t be afraid to peek into the source code.
"""
[/color]
a_fast = pyublas.asarray(a, flavor=pyublas.SparseExecuteMatrix)
vec = numpy.random.randn(5)
res = a_fast * vec
print a_fast
print res
________________________________________________
另外,还有一个pyulbasext,不过看样子还没有写完。
不过是可以通过Boost Numeric Bindings(
http://mathema.tician.de/software/boost-bindings
)
来配合lapack作svd的(有现成的函数:代码见
http://d.hatena.ne.jp/blono/20080921/
)
此外这个人的blog不错,很多代码演示。
有空来给svd也封装一个python的接口:)
补充:
稀疏矩阵用[]的方式赋值很卡,要用set_element
[/size]
用法如下
import numpy
import pyublas
a = pyublas.zeros((5,5), flavor=pyublas.SparseBuildMatrix, dtype=float)
#SparseBuildMatrix是稀疏矩阵类型
#将第5行(行号从0开始),第2个元素赋值为19
a[4,2] = 19
#将第一行赋值为4
a[1]=4
#将a全部赋值为1
a[:]=1
#从a中切片出一个小矩阵
a[:3,:3]
#对a进行乘法运算,加,减类似
a=a*a
#可以添加一个小的块状矩阵
b = numpy.random.randn(2,2)
a.add_block(2, 2, b)
#打印出所有非0元素的位置和值
for i in a.indices():print i,a[i]
#a中非0元素的个数
print a.nnz
#对a中元素求和
print a.sum()
#array是什么意思???我没明白。。。也许array之后更快?
[color=orange]#更新,哦,我少看了一段:
"""
The SparseBuildMatrix flavor is designed for fastest possible assembly of sparse matrices, while the SparseExecuteMatrix flavor is made for the fastest possible matrix-vector product. There’s much more functionality here–don’t be afraid to peek into the source code.
"""
[/color]
a_fast = pyublas.asarray(a, flavor=pyublas.SparseExecuteMatrix)
vec = numpy.random.randn(5)
res = a_fast * vec
print a_fast
print res
________________________________________________
另外,还有一个pyulbasext,不过看样子还没有写完。
不过是可以通过Boost Numeric Bindings(
http://mathema.tician.de/software/boost-bindings
)
来配合lapack作svd的(有现成的函数:代码见
http://d.hatena.ne.jp/blono/20080921/
)
此外这个人的blog不错,很多代码演示。
有空来给svd也封装一个python的接口:)
补充:
稀疏矩阵用[]的方式赋值很卡,要用set_element
[/size]