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no.1
R环境
1.安装导入包
安装
install.packages('reshape2')
该安装方法仅适用于发布在cran上的包。
安装bioconductor上的安装包:
source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite()
biocLite("BiocUpgrade")
安装github上的安装包(svn,bitbucket,git,用devtools::install_这个就好了):
install.packages("devtools")
devtools::install_github('用户名/项目名')
升级包
update.packages()
R更新,当遇到相同文件时选择跳过,否则新版本的更新会被老版本替代:
install.packages("installr")
library(devtools)
library(installr)
check.for.updates.R()
installr()
copy.packages.between.libraries()
升级之后更新包,可以使用y叔的rvcheck包,更新CRAN, Bioconductor和Github上的R包:
rvcheck::update_all()
还有一些其他包,安装步骤不一致,当遇到问题时,推荐搜到这个包的发布网址,会有说明文档介绍如何安装。当然也可以咨询我。