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《GPU的革命》文章整理

整理几年前写的文章,或许对初学CUDA编程的朋友有帮助:CUDA 线程执行模型分析(一)招兵------ GPU的革命CUDA 线程执行模型分析(二)大军未动粮草先行------GPU的革命CUDA硬件实现分析(一)------安营扎寨-----GPU的革命CUDA硬件实现分析(二)------规行矩步------GPU的革命CUDA编程接口(一)------一十八般武器------GPU的革命C...
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Windows下搭建deepnet环境

deepnet windows下开发环境配置。...
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G-BLASTN: Accelerating Nucleotide Alignment by Graphics Processors论文提供下载

G-BLASTN的github地址 https://github.com/OpenHero/gblastn sourceforge地址http://sourceforge.net/projects/gblastn/ 主页:http://www.comp.hkbu.edu.hk/~chxw/software/G-BLASTN.html两年没日没夜的工作,终于收到回报了,K. Zhao and X.-...
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《大规模并行处理器编程实战(第2版)》今年翻译的一本书出版

《大规模并行处理器编程实战(第2版)》今年翻译的一本书,终于出版了,这本书原作者写得很不错,我们翻译的水平有限,希望大家轻拍……http://product.china-pub.com/3768940...
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回答一封读者的来信

读者的内容就不公布了……下面直接是回复:***,你好,很荣幸,你能把我当成大哥,给我讲这些学习和生活中的疑虑。我知道舟山是一个美丽的城市,不过一直还没有机会去过,以后或许有机会一定回去看看。大四的学生或许都会经历的一个过程,或许不只是大四的学生,甚至工作一两年以后我们都会有这样的烦恼。这个过程或许是我们在学习中没有给自己的未来有一个好的规划,也不知道现在市面上的这么多的职业,那些是适合自己的。或许...
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G-BLASTN 1.1 Released

http://www.comp.hkbu.edu.hk/~chxw/software/G-BLASTN.htmlG-BLASTN is a GPU-accelerated nucleotide alignment tool based on the widely used NCBI-BLAST.  G-BLASTN can produce exactly the same results as N...
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制作poster+香港打印流程

学校组织参加香港的ACM-HK会议,boss要我们投了一个poster。这个好像只收poster和demo,哥虽然提交了demo,但是却只收了我的poster。。。。好吧,难不成poster和demo一个东东,就先忽略一个?别的不多说了。然后poster的过程:首先用ppt打开一个新页面,设置slide的大小:如下图:一般设置为A1的大小就可以了。后面在ppt上面写字,画图啥的,这个就不用多说了,...
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香港浸会大学计算机系异构计算实验室招收RA

香港浸会大学计算机系异构计算实验室招收RA要求,熟悉异构编程,熟悉CUDA,OpenCL等异构编程语言优先。简历请发送到kyzhao(at)comp.hkbu.edu.hk...
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blast数据库含义

Databasesblast的数据库里面有这几个数据库,每一个的具体含义:https://ncisf.org/index.php?q=software-databases/blast-databasesA list of the databases available on the cluster, including information about the database, it's so...
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NCBI SRA数据预处理

SRA数据的的处理流程大概如下一、SRA数据下载、NCBI 上存储的数据现在大都存储为SRA格式。下载以后就是以SRA为后缀名。这里可以通过三种方式下载SRA格式的数据。1.通过http方式,2.通过ftp方式,3.通过AsperaAspera可以在NCBI网站上下载。参阅:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK47540/二、SRA格式转换成FASTQ格式./...
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【G-BLASTN 1.0正式发布】

【G-BLASTN 1.0正式发布】G-BLASTN使用GPU来加速NCBI-BLAST里的BLASTN模块,单块GTX780比四核CPU平均快6倍。...
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CUDA 5.5 Production Release

CUDA 5.5 Production Release is now available to everyone athttps://developer.nvidia.com/cuda-downloads值得一提的是针对ARM的release出来了。ARM高性能计算,各个公司都在为接下来几年的发展开始圈地了。。...
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CUDA Toolkit 5.5 Release Candidate (RC)

CUDA Toolkit 5.5 Release Candidate (RC). This important update to the CUDA platform and programming model includes:Support for ARM PlatformsNative compilation, for easy application portingFast cross-c...
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The Most Important Algorithms

The Most Important Algorithmshttp://www.risc.jku.at/people/ckoutsch/stuff/e_algorithms.htmlAfter a long discussion with some of my RISC colleagues about what the 5 most important algorithms on the wor...
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CUDA 5.5 Release Candidate

The CUDA 5.5 Release Candidate is now available for download. As a CUDA® Registered Developer, you now have access to all the latest features such as:        •  Multi-process MPI debugging & profiling...
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