你是不也在愁没数据?来看看Open Data吧!
前几天在北京国际会议中心参加了「中国神经科学临床与转化高峰论坛」,其中有一个会场就是「大数据与临床登记研究论坛」,从大数据的建设、大数据的分析技术到大数据的共享,都谈论了很多。其实这两年来,我陆陆续续也听了不少关于大数据的会,在医药领域大数据的会也参加了不止一两次,不过,坦率而言,并没有什么印象深刻,能拿的出手的大数据医药分析案例。但在数据开放,数据共享方面我们到是看到了一些实实在在的东西。
我尝试找了找比较有影响力的开放数据资源,当然,这只是一个不完全整理,不是系统综述。
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欧盟:http://publicdata.eu/
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英国政府:https://data.gov.uk/
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美国政府:http://www.data.gov/
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日本政府:http://www.data.go.jp/
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中国政府:http://data.stats.gov.cn/
除了国家层面外,一些力争「智慧城市」的城市,也开始对公众开放城市数据,比如下面这个:
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纽约:https://nycopendata.socrata.com/
国内的城市也在奋力追赶,比如:
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北京:http://www.bjdata.gov.cn/
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上海:http://www.datashanghai.gov.cn/
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深圳:http://data.szmb.gov.cn/
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贵阳:http://www.datagy.cn/
作为一个医药界的筒子,我当然更关注医药领域的开放数据。一来可以发Paper,二来也能试试统计方法,三来还可以自己用来做讲座,讲课培训材料。
医药卫生公共数据也主要掌握在政府手里,比如:
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美国健康和人类服务部:http://www.healthdata.gov/
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美国老人医保数据:https://data.medicare.gov/
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中国国家人口与健康科学数据共享平台:http://www.ncmi.cn/1
这是一个大杂烩,医学领域数据,应有尽有,一定要多笔墨安利一下是,虽然数据的获取程序很繁琐。
「国家人口与健康科学数据共享平台」是国家科技基础条件平台组成部分。该平台包括一个平台管理中心(总中心)和六个科学数据中心(基础医学、临床医学、公共卫生、中医、药学、人口与生殖健康)及平台地方节点。建立起一个数据分布式存储、集中管理和多点服务的平台架构,物理上合理分布,层次分明;逻辑上高度统一,充分共享。为政府决策、科技进步和医疗卫生事业发展提供科学数据支撑,为中国健康产业发展和百姓健康保障提供数据共享和信息服务。
地方的卫生部门也有公开数据,比如加州:
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CHHS:https://chhs.data.ca.gov/
此外,还有一个特别好用的流调项目公开数据,去年有个在国外念Ph.D的小师妹,就靠这个做了博士论文,然后,然后人家就这么毕业了。这对于我们苦苦在现场收集问卷,测量血压,收集血样尿样的筒子们绝对是1GB的伤害。
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CHNS(China Health and Nutrition Survey): https://chhs.data.ca.gov/
你没看错,这个其实就是我们中国自己的「居民健康与营养调查」的数据,其实走「国家人口与健康科学数据共享平台」也能申请到,但是我走这个通道,呵呵,你晓得滴。
最后,我想说的是,做临床试验的都知道,CDISC都推行这么多年了,CFDA也在推行了,什么时候能有Clinical trial的开放数据啊?
别说,我还真发现一个,当我看到他的谚语时,我嘴角划过一丝微笑。
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The Yale University Open Data Access (YODA) Project: http://yoda.yale.edu/
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