Caffe 编译错误记录

Caffe 编译错误记录

装了opencv 3之后，以前可以编译成功的的caffe总是出现错误，现记录下来，作为备份：

• 1、build_release/lib/libcaffe.so：对‘cv::imdecode(cv::_InputArray const&, int)’未定义的引用
  对于各种cv出错：
  解决方法：
  修改Makefile:
  LIBRARIES += glog gflags protobuf boost_system boost_filesystem m hdf5_serial_hl hdf5_serial matio opencv_core opencv_highgui opencv_imgproc opencv_imgcodecs
  下次编译之前要 make clean

• 2、make: /usr/local/bin/mexext：命令未找到
  sudo ln -s /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/mexext /usr/local/bin

警告: 您使用的 gcc 版本为 ‘5.4.0’。不支持该版本的 gcc。MEX 当前支持的版本为 ‘4.9.x’。有关当前支持的编译器列表，请参阅: http://www.mathworks.com/support/compilers/current_release。
不管它。

• 3、m//home/yali/anaconda2/lib/libpng16.so.16：对‘inflateValidate@ZLIB_1.2.9’未定义的引用
  sudo ln -s /home/yali/anaconda2/lib/libpng16.so.16 libpng16.so.16 （方法不行）
  正确解决方法：
  在 Makefile.config 中，加入下一句
  LINKFLAGS := -Wl,-rpath,$(HOME)/anaconda/lib

• 4、python/caffe/_caffe.cpp:10:31: fatal error: numpy/arrayobject.h: No such file or directory
  解决方法：没装numpy的先安装
  sudo apt-get install python-numpy
  然后 sudo find / -name numpy，显示
  /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include/numpy
  /usr/share/numpy
  /usr/include/python2.7/numpy
  /usr/include/numpy
  /usr/lib/python2.7/dist-packages/Cython/Includes/numpy\
  然后对照 Makefile.config
  将第二行加一个local
  PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python2.7 \
  /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/includ

• 5、ImportError: No module named caffe
  解决方法1：
  首先新建一个py文件，命名为_init_paths.py 里面写入如下代码：

import os.path as osp
import sys

def add_path(path):
    if path not in sys.path:
        sys.path.insert(0, path)

this_dir = osp.dirname(__file__)

#Add caffe to PYTHONPATH
caffe_path = osp.join(this_dir, '..', 'caffe', 'python')  #注意路径：this_dir表示当前路径，‘..’返回上一层的caffe所在的路径，根据自己的caffe所在路径修改
add_path(caffe_path)

每次使用caffe的时候在 import caffe 前面加上 import _init_paths 即可：

import _init_paths # _init_paths.py 和当前命令放在同一路径下
import caffe

解决方法2:

caffe_root = '/home/mmt/Desktop/caffe/)'  
import sys
sys.path.append("/home/mmt/Desktop/caffe/python")
sys.path.append("/home/mmt/Desktop/caffe/python/caffe")
import caffe

• 6、编译Fast -rcnn时的错误

./include/caffe/util/cudnn.hpp:124:41: error: too few arguments to function
‘cudnnStatus_t cudnnSetPooling2dDescriptor(cudnnPoolingDescriptor_t, cudnnPoolingMode_t, cudnnNanPropagation_t, int, int, int, int, int, int)’
解决方法：

1.将./include/caffe/util/cudnn.hpp 换成最新版的caffe里的cudnn的实现，即相应的cudnn.hpp.
2.将./src/caffe/layer里的，所有以cudnn开头的文件，例如cudnn_lrn_layer.cu，cudnn_pooling_layer.cpp，cudnn_sigmoid_layer.cu。
rbgirshick的py-faster-rcnn实现，因为其cudnn实现为旧版本的实现，所有出现了以上问题.
然后 make clean，再重新编译

src/caffe/layers/cudnn_softmax_layer.cpp:6:48:
fatal error: caffe/layers/cudnn_softmax_layer.hpp: No such file or directory

将新版本caffe中的 incliude里面的layer文件夹移过去  

• 7、ImportError: libprotobuf.so.8: cannot open shared object file: No such file

解决方法：http://blog.csdn.net/yl33489/article/details/73605398
http://blog.csdn.net/hailong0715/article/details/52057873

说明你使用的protobuf要么是没有编译过，所以找不到对应的库文件，要么就是您编译之后的安装路径没有假如到配置中所以报错。
如果是第一种，请先下载protobuf-2.5.0，我已经上传到网盘http://pan.baidu.com/s/1pKAgqp1
如果是第二种情况：
则需要创建新文件：/etc/ld.so.conf.d/libprotobuf.conf ，然后在其中加入内容：/usr/local/lib

• 8、TypeError: slice indices must be integers or None or have an _index_ method
  说是numpy版本的问题。

解决方法：
sudo pip install -U numpy==1.11.0
 python -c "import numpy; print numpy.__version__"

• 9、ImportError: numpy.core.multiarray failed to import

重新 make fasterrcnn/lib

10、SystemError: NULL result without error in PyObject_Call

解决方法：  
sudo apt-get install python-yaml

• 10、./include/caffe/util/cudnn.hpp:8:34: fatal error: caffe/proto/caffe.pb.h: No such file or director

解决方法：
sudo pip install protobuf --upgrade -i http://pypi.douban.com/simple 
sudo pip install pillow --upgrade -i http://pypi.douban.com/simple

• 11、/lib/rpn/proposal_layer.py:175: RuntimeWarning: invalid value encountered in
  训练到8060次发生错误

解决方法：
将
1）A possible solution could be to decrease the base learning rate in the solver.prototxt（只能延迟错误出现的时间）
As it is recommended here http://caffe.berkeleyvision.org/tutorial/solver.html
Just change the base_lr: 0.001 to 0.0001
2）修改/py-faster-rcnn/lib/datasets/pascal_voc.py第204-207行，修改结果如下：（不顶用）

x1 = float(bbox.find('xmin').text)
y1 = float(bbox.find('ymin').text)
x2 = float(bbox.find('xmax').text) 
y2 = float(bbox.find('ymax').text)

3）修改config中的RNG_seed, 只能延缓出现错误的时间。

• 12、error Check failed: error == cudaSuccess(77 vs 0) an illegal memory access was encountered
  这是我在进行test的时候遇到的，训练的时候没有出错

解决方法：
将
ROIPoolBackward<Dtype><<<CAFFE_GET_BLOCKS(count), 16>>>(numpy.__version__"
中的16该一下行了，修改如下：
ROIPoolBackward<Dtype><<<CAFFE_GET_BLOCKS(count), CAFFE_CUDA_NUM_THREADS>>>

• 13、libcudart.so.8.0: cannot open shared object file: No such file or directory

首先打开bashrc文件：gedit ~/.bashrc

在文件末尾加入环境变量，如64-bit：export LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/cuda/lib64"

保存文件退出，在终端保存加载设置：soucre ~/.bashrc 
或者 
sudo cp /usr/local/cuda-8.0/lib64/libcudart.so.8.0 /usr/local/lib/libcudart.so.8.0 && sudo ldconfig

• 14、ImportError: No module named cv2

sudo apt-get install python-opencv

• 1５、　ＭＡＴＬＡＢ　ｃａｆｆｅ　运行错误　
• _ZN2cv8imencodeERKNSt7__cxx1112basic_stringIcSt11char_traitsIcESaIcEEERKNS_11_InputArrayERSt6vectorIhSaIhEERKSB_IiSaIiEE.
  -先把　/usr/lib/x86_64-linux-gnu　里面的链接删掉或者保存起来
  sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_core.so.2.4.9 libopencv_core.so.2.4
  sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4.9 libopencv_highgui.so.2.4
  sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_imgproc.so.2.4.9 libopencv_imgproc.so.2.4
• 1６、　ＭＡＴＬＡＢ　ｃａｆｆｅ　运行错误　
  Invalid MEX-file ‘/home/yali/Desktop/YALI/faster_rcnn/external/caffe/matlab/+caffe/private/caffe_.mexa64’:
  /usr/local/MATLAB/R2016b/bin/glnxa64/../../sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.２１’ not found (required by
  /home/yali/Desktop/YALI/faster_rcnn/external/caffe/matlab/+caffe/private/caffe_.mexa64).

sudo ln -sf /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6.0.２１　/usr/local/MATLAB/R201６ｂ/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6