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RSS订阅转载 SSR标记与SNP标记
SSR：简单序列重复，SSR标记纪录的是对一段重复的简单序列的编码（编码一般都不是binary的）SNP：单点多态，SNP标记纪录的是一个等位位点上的不同碱基（编码一般是binary的，除非位点不是biallele的）SSR不可能位于功能基因的内部（根据其结构特征，功能基因内部不可能有类似SSR的重复模式的简单序列），而SNP可能出现在功能基因的内部。以下内容转
2013-04-16 10:40:15
12166
原创 how to calculate ANOVA
有段很好的视频:http://www.youtube.com/watch?v=-yQb_ZJnFXw
2013-04-07 11:20:05
756
原创 数据特性概要
1.多环境2.多等位基因3.有缺失4.只有genotype和phenotype数据，没有pedigree和map(marker info)数据5.观察数(n)大于标记数(p)6.数据规模小
2013-04-03 11:33:32
701
原创 数据预处理(第一天)
将excel文件另存为csv格式（不支持多个sheet，每个sheet保存为独立的csv文件）4个csv文件：1.基因型：genotype.csv，375行105列，每行为一个line（第一列为line编号）。编码方式：纯合体用1位数1~n（n种不同等位基因型，n最大为7）表示，杂合体用2位数xy（x,y:1~n）表示，未测定的用-9表示（原文件中line 332, RM10376，闪闪标
2013-04-03 11:13:24
1215
原创 JS-Estimator与EB
JS-Estimator: the James-Stein EstimatorEB: Empirical BayesEmpirical Bayes methods are procedures for statistical inference in which the prior distribution is estimated from the data. This ap
2013-04-02 09:30:53
813
空空如也
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