Linux
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swuteresa
这个作者很懒,什么都没留下…
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Ubuntu的软件安装
通常在这几个地方:/bin/usr/bin/home/yourname/bin通常是被隐藏的,先设置:查看-显示隐藏文件转载 2013-07-31 09:15:27 · 647 阅读 · 0 评论 -
Hadoop虚拟集群的搭建
主要参考:1. http://blog.csdn.net/bluetropic/article/details/93356752. http://blog.csdn.net/hguisu/article/details/7237395一、环境介绍:2个节点的虚拟机VMware,Ubuntu12.04 二、修改机器名sudo vi /etc/hostname原创 2013-10-30 21:31:18 · 1026 阅读 · 0 评论 -
包affy,arrayQualityMetrics和RankProd的安装
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("affy")biocLite("arrayQualityMetrics")biocLite("RankProd")install Cairo in R should run these two commands first:sudo apt-get insta原创 2014-01-17 11:08:22 · 4931 阅读 · 1 评论 -
Linux中chmod命令:修改文件或文件夹的权限
原文地址:http://www.cnblogs.com/zhj5chengfeng/p/3302440.html一. 文件(文件夹)的权限问题 一个文件或者文件夹,使用它的人有三类:root、当前用户和其他用户,例如,我们可以通过 ls -l xxx.xxx 来查看文件 “xxx.xxx” 的权限,比如我查看 /var/log/ 中的 boot.log 文件的权限:ls -l转载 2014-03-19 08:45:08 · 2054 阅读 · 0 评论 -
Linux中chown命令:修改目录或文件的所有权
原文地址:http://zhaoyuqiang.blog.51cto.com/6328846/1214718 文件与目录不仅可以改变权限,其所有权及所属用户组也能修改,和设置权限类似,用户可以通过图形界面来设置,或执行chown命令来修改。我们先执行ls -l看看目录情况:上图,查看zhaoyuqiang.html文件的权限,红色区域表转载 2014-03-19 08:46:56 · 7253 阅读 · 0 评论 -
win 7 home版R package打包、发布、安装
首先,当然需要安装好R(假设安装目录为C:\Program Files\R\R-3.0.2)和Rtools(假设安装目录为C:\Rtools)1、在命令行模式下,修改环境变量,增加RTools和R在你的电脑上的安装目录下的bin子目录set path=C:\Program Files\R\R-3.0.2\bin;C:\Rtools\bin;%path%由于这一修改不是永久性的,原创 2013-11-18 16:43:50 · 1895 阅读 · 0 评论 -
Fix the Problem with MergeList
I've had this error on numerous occassions this year (2014). After reading the reply and guessing at the action needed to fix it - stabbing at buttons in desperation - it's been fixed - I think.In转载 2014-05-30 08:55:49 · 1185 阅读 · 0 评论 -
Linux新建和增加Swap分区
以前做过增加swap分区的事情,今天一个同事问到我如何做,故记个笔记整理一下吧。另外,以前我写过“交换分区swap的大小分配”,大家也可先看一下。我们都知道在安装Linux系统时在分区时可以分配swap分区,而系统安装后(在运行中)如何建立或调整swap分区呢?在装完Linux系统之后,建立Swap分区有两种方法。1.新建磁盘分区作为swap分区2.用文件作为swap分区 (操作更转载 2014-07-31 13:14:59 · 844 阅读 · 0 评论 -
For faster R use OpenBLAS
From: http://www.stat.cmu.edu/~nmv/2013/07/09/for-faster-r-use-openblas-instead-better-than-atlas-trivial-to-switch-to-on-ubuntu/转载 2014-09-19 15:33:11 · 2097 阅读 · 0 评论 -
Ubuntu搭建hadoop单机版伪分布环境
原文地址:http://os.51cto.com/art/201211/364167.htm在11月初的时候,我们了解了Ubuntu 12.04 搭建 hadoop 集群版环境的方法,今天再来看看在单机版环境中,Ubuntu12.04搭建hadoop是如何实现的。一. 你要安装Ubuntu这一步省略;二. 在Ubuntu下创建hadoop用户组和用户;1原创 2013-07-24 10:20:45 · 3812 阅读 · 0 评论 -
ubuntu下安装、启动和卸载SSH
ubuntu默认并没有安装ssh服务,如果通过ssh链接ubuntu,需要自己手动安装ssh-server。判断是否安装ssh服务,可以通过如下命令进行:$ ssh localhostssh: connect to host localhost port 22: Connection refused如上所示,表示没有还没有安装,可以通过apt安装,命令如下:$转载 2013-07-19 10:23:34 · 52352 阅读 · 4 评论 -
ubuntu:更新内核与清理无用文件
编辑软件源 sudo gedit /etc/apt/sources.list 查看系统存在的内核。 dpkg -l|grep linux 或dpkg –get-selections|grep linux 显示当前的内核 uname -a 升级内核 apt-get dist-upgrade 删除内核 sudo apt-get remove转载 2013-07-31 08:58:18 · 890 阅读 · 0 评论 -
ubuntu配置open-mpi笔记(虚拟机)
原文地址:http://chenwenxuan.com/2013/02/17/ubuntu-openmpi/在ubuntu上尝试配置了一下open-mpi,在虚拟机上完成。从安装ubuntu到配置完成mpi的过程。整理一下。1. 安装ubuntu先下载iso文件,ubuntu-12.04.1-server-i386.iso,这个ubuntu不会启动ui界面,适合在虚转载 2013-07-31 13:22:45 · 3086 阅读 · 0 评论 -
ubuntu下安装openMPI
1.确认以下编译器已安装:gcc --versiong++ --versionpython --version2.下载(默认至当前用户的Downloads目录下)URL: http://www.open-mpi.org/software/ompi/v1.6/目前版本:openmpi-1.6.5.tar.gz3.解压openMPI安装文件,放在当前原创 2013-07-22 10:12:27 · 20098 阅读 · 1 评论 -
Ubuntu命令行下载JDK
1. 用Google chrome浏览器打开Oracle的JDK下载页面http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk7-downloads-1880260.html2. 接受协议3. 选择需要的版本,点击,开始下载4. 查看"downloads",暂停下载任务,复制下载URL5. 回Ubuntu命令行,执行:原创 2013-10-28 20:23:13 · 11673 阅读 · 0 评论 -
Hadoop 常见问题总结
出现问题以后先查看日志,以下是常见的错误情况1 地址占用org.apache.hadoop.hdfs.server.namenode.NameNode: Address already in use查找被占用的端口号对应的PID : netstat -tunlpkill -9 PID实在不行就killall -9 java2 s转载 2013-10-29 16:38:11 · 918 阅读 · 0 评论 -
配置与使用Hadoop的问题
1.用户组对数据目录必须拥有写权限chmod g-w /hadoop/data/ 或者 chmod 755 /hadoop/data2.单机模式下,output和input文件夹在本机上,而在伪分布模式下,必须位于hdfs文件系统中,否则报错:Input path does not exist方法一:建立本地目录:mkdir input拷贝文件至目录:cp原创 2013-07-25 14:36:01 · 4218 阅读 · 0 评论 -
终于配好Hadoop
经过5天的奋战,终于在两个节点的虚拟机上配好了Hadoop分布式环境,mark一下。主要是由于自己技术底子不好,以前没用过Linux,也不搞开发,家里电脑出问题了一般都是老公出面搞定的,哎……接下来是更为艰巨的,算法并行化设计,以及分布式环境下的程序调试。对于技术盲大妈来说,真的是伤不起啊。原创 2013-10-30 16:39:33 · 1171 阅读 · 1 评论 -
install Cytoscape on Ubuntu
Download the Cytoscape installation file for Linux from www.cytoscape.orgOpen a terminal and change the execution file propertychmod a+x Cytoscape_3_0_2_unix.shStart installation转载 2014-08-27 10:55:05 · 3143 阅读 · 0 评论