- 博客(12)
- 资源 (2)
- 问答 (1)
- 收藏
- 关注
RSS订阅转载 R语言-绘制ROC曲线
浅谈ROC曲线机器学习中很常见的一个大类就是二元分类器。很多二元分类器会产生一个概率预测值，而非仅仅是0-1预测值。我们可以使用某个临界点（例如0.5），以划分哪些预测为1，哪些预测为0。得到二元预测值后，可以构建一个混淆矩阵来评价二元分类器的预测效果。所有的训练数据都会落入这个矩阵中，而对角线上的数字代表了预测正确的数目，即True Positive+True Nagetive。同时可以相应算出
2016-04-14 21:28:35
65340
13
翻译 ggplot2-一页多图(不同来源, 灵活绘制)
本文更新地址:http://blog.csdn.net/tanzuozhev本文在 http://www.cookbook-r.com/Graphs/Multiple_graphs_on_one_page_(ggplot2)/ 的基础上加入了自己的理解ggplot2 的分面(facet)可以绘制一页多图, 但是必须是来自同一个数据集的图形,局限性很大. 如果我们有多个不同来源的图形,想绘制到一张图
2016-04-10 12:37:11
40320
4
翻译 ggplot2-设置图例(legend)
本文更新地址:http://blog.csdn.net/tanzuozhev/article/details/51106909本文在 http://www.cookbook-r.com/Graphs/Scatterplots_(ggplot2)/ 的基础上加入了自己的理解图例用来解释图中的各种含义,比如颜色,形状,大小等等, 在ggplot2中aes中的参数(x, y 除外)基本都会生成图例来解释
2016-04-09 22:25:25
156163
4
翻译 ggplot2-设置坐标轴
本文在 http://www.cookbook-r.com/Graphs/Axes_(ggplot2)/ 的基础上加入了自己的理解基本箱线图library(ggplot2)bp ggplot(PlantGrowth, aes(x=group, y=weight)) +
2016-04-09 21:28:38
82595
2
翻译 ggplot2–绘制分布图
ggplot2–绘制分布图本文更新地址:本文在 http://www.cookbook-r.com/Graphs/Plotting_distributions_(ggplot2)/ 的基础上加入了自己的理解生成绘图数据set.seed(1234)dat data.frame(cond = factor(rep(c("A","B"), each=200)),
2016-04-09 17:26:50
36939
翻译 ggplot2-为折线图和条形图添加误差线
采用ggplot2绘制折线图和条形图,并添加误差线.ggplot2只能处理 data.frame数据,每列作为一个变量,是一个指标.以ToothGrowth数据为例,进行处理tg ToothGrowthhead(tg)## len supp dose## 1 4.2 VC 0.5## 2 11.5 VC 0.5## 3 7.3 VC 0.5## 4 5.8
2016-04-09 16:58:56
70456
2
翻译 Feather R语言和Python交互式硬盘存储格式
本文最近更新地址 本文参考：http://blog.rstudio.org/2016/03/29/feather/R语言大神Hadley的有一力作：Feather。 Feature是一种文件格式，支持R语言和Python的交互式存储，速度更快。目前支持R语言的data.frame和Python pandas 的DataFrame。Feather收到了Apache arrow 项目的支持
2016-04-07 20:12:22
9338
翻译 <二代测序> 批量下载 NCBI sra 文件
前文 http://blog.csdn.net/tanzuozhev/article/details/51077222 介绍了如何采用 sra-toolkit 下载 sra 文件，但是如果你想下载整个项目的所有样本，应该怎样批量下载呢，下面参考biostar网站的部分回帖，做简单介绍。R语言 SRAdb 包参考 https://www.biostars.org/p/93494/# 安装sou
2016-04-06 21:00:25
16144
翻译 <二代测序> 下载 NCBI sra 文件
随着测序技术的不断提高，二代测序数据成指数增长。 NCBI提供了SRA数据库存储这些数据。 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra为了方便更好的分析这些数据，NCBI提供了下载的命令行工具：sra-toolkit。包括以下命令： 官方文档： http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=toolkit_do
2016-04-06 18:19:04
20999
1
linux非root安装软件设置
2016-04-13
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人