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转载 Build CP2K using Intel Fortran compiler Professional Edition
http://software.intel.com/en-us/articles/build-cp2k-using-intel-fortran-compiler-professional-edition/Introduction : CP2K (http://cp2k.berlios.de/) is a freely available (GPL) program, written
2012-05-31 23:09:18 1658
转载 从源码编译安装软件经验+技巧
从源码编译安装东东,不是很容易,想想在使用lfs之前,源码编译安装软件从来没成功过,甚至出现错误都无从下手,只能放弃 :( 经过lfs的洗礼,总算对源码编译安装有了一点认识,可惜当初没有把这些经验写下来 :(不过现在开始写也不迟 :) 将编译中遇到的问题及解决的方法记下来,积累经验,也可以让来往的newbie对源码安装软件了解一些,多一些成功机率,毕竟从源码包编译东东还是有一
2012-05-30 08:55:17 668
转载 OpenMPI-1.6
(1)进入到下载目录安装tar -xvf openmpi-1.6.tar.gzcd openmpi-1.6./configure --prefix=/opt/openmpi-1.6 | tee /opt/cfg.logmake all | tee /opt/make.logmake install | tee /opt/install.log(2)然后修改配置vi /e
2012-05-29 14:56:05 1632
转载 cp2k x86_64的串行/并行编译(ubuntu/SUSE, GNU编译器)
1. Introduction大多数的分子动力学模拟采用经典分子力学来计算能量和粒子的在运动中受到的力。但是一般的分子力学力场很难处理反应体系,强极化体系,和一切涉及电子激发的体系。这些体系需要精确计算电子结构。 采用基于DFT理论,平面波函数和赝势的分子动力学模拟被称为第一性原理MD(分子动力学)。第一性原理指的是DFT,与HF被称为ab initio(从头算)相对应。第
2012-05-28 15:48:05 4139
原创 Obtaining CP2K
ftp://ftp.berlios.de/pub/cp2k/cp2k.tar.gzhttp://www.cp2k.org/index.php/obtaining SVN INSTALL http://svn.apache.org/repos/asf/subversion/trunk/INSTALLhttp://wiki.centos.org/HowTos/Subversi
2012-05-28 15:41:43 1255
原创 英文月份缩写
英文月份缩写 一月份=JAN. Jan.=January 二月份=FEB. Feb.=February 三月份=MAR. Mar.=March 四月份=APR. Apr.=April 五月份=MAY May=May 六月份=JUN. Jun.=June 七月份=JUL. Jul.=July 八月份=AUG.
2012-05-28 10:12:35 5636
原创 PP相关资源
http://newsletter.ascc.sinica.edu.tw/news/read_news.php?nid=1658Pipeline Pilot使用簡介前言多年來,計算中心所提供的生物基因資料庫GCG及SeqWeb服務,因原廠Accelrys公司不再提供GCG之維護與更新作業,故自今(98)年2月15日起,中心不再提供SeqWeb服務,而改由Accelrys P
2012-05-25 23:48:34 891
原创 Terachem1.5安装(cuda)
系统:centos6.2,gtx580========================================Configuring SDK Makefile (/usr/NVIDIA_GPU_Computing_SCK/C/common/common.mk)...Configuring SDK Makefile (/usr/NVIDIA_GPU_Computing_SCK/O
2012-05-22 09:54:22 917
转载 linux 用户设置修改
linux下创建用户1、添加ftp用户useradd ftpname -d /home/ftppasswd ftppwd以下操作都以root权限进行:service vsftpd start 启动Linux自带的FTP服务2. 添加普通用户 useradd nagios –d /usr/local/nagioschown nagios.nagios /usr/loc
2012-05-17 20:53:29 581
转载 NVIDIA Fermi GPU架构简单解析
在过去的几年中,GPU的发展产生了较大的变化,GPU强大的性能被局限于处理图形渲染的任务,无疑是对计算资源的浪费,随着GPU可编程能力不断提高,通用计算(GPGPU: General-purpose computing on graphics processing units)应运 而生,目前已经取得部分显著成效,部分应用带来的性能提升也是非常可观.在DirectX 10规范之前的GP
2012-05-17 13:21:59 1495
转载 首个完全基于GPU的量化软件-TeraChem杂谈及真实性能测试
TeraChem是第一个公布于世的、完全基于GPU运算的从头算量化程序,2010年5月发布第一版。虽然很早就听说过此程序,但直到近日才终于有机会亲自把玩,此文将杂谈此程序的一些特征,并且实际测试一下此程序的性能,看看到底有没有官方吹得那么玄,是否值得为此投资。本文的测试是确保公平的,鉴于寡人知识水平不敢说在讨论上一定正确,但可以保证没有任何偏向。1 简介TeraChem是2011年刚评
2012-05-17 12:50:54 4999 1
原创 AMBER12 QM/MM: is d-orbital code going to be parallelized?
his message: [ Message body ] [ More options (top, bottom) ]Related messages: [ Next message ] [ Previous message ] [ In reply to ] [ Next in thread ] [ Replies ]Contemporary messages sorted
2012-05-10 21:15:25 1659
转载 CentOS Linux利用ntfs-3g挂载读写Windows的ntfs分区
Linux下想访问NTFS分区,现在普遍的方法是利用ntfs-3g或者内核模块来实现。一、安装ntfs-3g模块1. 使用yum的安装方法:请确定你已经安装了rpmforge软件库的源。请参考:RHEL/CentOS 5.5使用第三方软件库然后安装下列组件。yum install fuse ntfs-3g -y注:如果你在使用 CentOS 5.3 或更旧版本,那么
2012-05-10 15:45:05 868
转载 Visual Studio 2010 中CUDA 4.0的安装与配置
安装环境:Win7 64位系统,Geforce GT 430显卡安装前提: Visual Studio 2010 Visual Assist X安装步骤:1,Nvidia显卡驱动,装275.33版,这是最新版本驱动,初次安装为了少出错,最好安装比较新版本的驱动。2,Cuda Toolkit 4.0安装,CUDA 4.0
2012-05-10 13:20:28 480
转载 centos网络配置(手动设置,自动获取)的2种方法
一定要做好备份工作,特别是对于新手来说,如果修改的地方多了,你也会搞晕的,所以修改一个文件前一定要备份一,修改文件来设置网络连接1,自动获取IP的方法自动获取根4个文件有关系a),/etc/sysconfig/network-scripts/ifcfg-eth0[zhangy@localhost network-scripts]$ cat ifcfg-eth0# Mar
2012-05-09 17:49:35 875
转载 centos 6.2用yum安装中文输入法
centos 6.2用yum安装中文输入法1.su root2.yum install "@Chinese Support"3.exit4.回到桌面,system->preferences->input method5.如果没有,先注销一下。6.按照提示添加输入法。7.最后 再次注销,登录即可。
2012-05-09 15:11:56 530
转载 Linux 防火墙
1) Linux操作系统中永久性生效,重启后不会复原开启: chkconfig iptables on关闭: chkconfig iptables off2) 即时生效,重启后复原开启: service iptables start关闭: service iptables stop需要说明的是对于Linux操作系统中的其它服务都可以用以上命令执行开启
2012-05-08 20:22:22 371
转载 CentOS关闭图形界面(x window)
1.在图像界面关闭x window:1.1 shell中运行 init 3 进入文本模式,同时会关闭相关的服务(Xserver 肯定关闭)1.2 Alt+Ctrl+F1~F6到字符界面,root登陆,ps aux|grep /usr/X11R6/bin/X,得到X进程号, kill -9 进程号,其实这时已经到文本界面了,没必要关X。(这样太粗鲁了)2.如果你想一开机后不进入
2012-05-08 11:17:51 559
转载 DiscoveryStudio31 program for first-time
If you are running the DiscoveryStudio31 program for first-time, it will show following error.>:~/Accelrys/DiscoveryStudio31/bin$ ./DiscoveryStudio31 License Pack location (%LP_LOCATION%) is not a
2012-05-07 22:43:36 877
翻译 在rescue模式修复GRUB
1. 使用救援光盘引导进入rescue模式。2. 系统会提示加载硬盘文件系统到/mnt/sysimage,用读写模式加载。3. 检查mount的输出保证文件系统加载正确。4. #chroot /mnt/sysimage {切换到磁盘根目录,使用chroot shell}5. #fdisk -l /dev/sda {使用fdisk检查分区}6. #cat /boot/g
2012-05-05 15:39:53 531
转载 用U盘通过局域网来安装CentOS 6.0
用U盘通过局域网来安装CentOS 6.02011年10月25日 ⁄Linux ⁄ 暂无评论教程引言:实现目的:用U盘通过局域网来安装CentOS 6.0适用范围:有2台电脑,并且能组建成局域网,要安装CentOS 6.0的电脑支持U盘启动。(此方法比较适合IDC机房给客户机器装机,无需刻录光盘,只要一个U盘即可安装系统,方便实用)所需工具:系统运维 www
2012-05-03 16:01:55 659
空空如也
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