mahout 源码解析之聚类--Canopy算法

Canopy算法的实现在包org.apache.mahout.clustering.canopy中。

一、算法基本思想

算法基本思想如下：

（1）、将数据集向量化得到一个list后放入内存，选择两个距离阈值：T1和T2，其中T1 > T2，T1和T2的值可以用交叉校验来确定；

（2）、从list中任取一点P，用低计算成本方法快速计算点P与所有Canopy之间的距离（如果当前不存在Canopy，则把点P作为一个Canopy），如果点P与某个Canopy距离在T1以内，则将点P加入到这个Canopy；
（3）、如果点P曾经与某个Canopy的距离在T2以内，则需要把点P从list中删除（不过在在新的mahout采用的 不加入新的Collection 这样后面处理的时候就不包含点P），这一步是认为点P此时与这个Canopy已经够近了，因此它不可以再做其它Canopy的中心了；
（4）、重复步骤2、3，直到list为空结束。

算法思想参考博客http://www.cnblogs.com/vivounicorn/archive/2011/09/23/2186483.html

二、源码分析

下面我们来看一下这个包里面的类。

2.1 CanopyConfigKeys

CanopyConfigKeys类主要定义了Canopy算法中需要使用的一些配置参数的名称。具体每个参数的作用如下：

		String T1_KEY = "org.apache.mahout.clustering.canopy.t1";
		String T2_KEY = "org.apache.mahout.clustering.canopy.t2";
		String T3_KEY = "org.apache.mahout.clustering.canopy.t3";
		String T4_KEY = "org.apache.mahout.clustering.canopy.t4";

T1和T2为算法设定的阈值，具体参见前面的算法思想，T3和T4也是，不同之处在与，在单机跑canopy算法时mahout只使用了T1和T2，在运行Map-Reduce版本的Canopys算法时，Map阶段使用的T1和T2，Reduce阶段使用的T3和T4，也就是说Map和Reduce阶段的阈值可以不一样。

		String CANOPY_PATH_KEY = "org.apache.mahout.clustering.canopy.path";//这个好像没有见到怎么用的
		String DISTANCE_MEASURE_KEY = "org.apache.mahout.clustering.canopy.measure";//canopy算法需要计算每个向量与canopy的距离，使用的就是这个
		String CF_KEY = "org.apache.mahout.clustering.canopy.canopyFilter";//这个是一个阈值，当一个canopy里面的样本数目大于这个阈值的时候才算作一个canopy

2.2Canopy

Canopy类继承了类DistanceMeasureCluster，没有做什么事情，真正实现canopy算法的是类CanopyClusterer。

2.3CanopyClusterer

CanopyClusterer的构造函数需要传入一个距离计算类和两个double类型的参数。

	public CanopyClusterer(DistanceMeasure measure, double t1, double t2) {
		this.t1 = t1;
		this.t2 = t2;
		this.t3 = t1;
		this.t4 = t2;
		this.measure = measure;
	}

我们也可以通过传入一个Configuration类型的变量来构造一个CanopyClusterer，其中Configuration是hadoop中的类，我们可以在这个Configuration对象中设定距离计算类，T1，T2，T3和T4等参数，

CanopyClusterer的构造函数会利用Configuration初始化类的属性。

	public CanopyClusterer(Configuration config) {
		this.configure(config);
	}

	public void configure(Configuration configuration) {
		// 初始化距离计算公式
		measure = ClassUtils.instantiateAs(
				configuration.get(CanopyConfigKeys.DISTANCE_MEASURE_KEY),
				DistanceMeasure.class);
		measure.configure(configuration);
		t1 = Double.parseDouble(configuration.get(CanopyConfigKeys.T1_KEY));
		t2 = Double.parseDouble(co