BWT(压缩与还原)

最新推荐文章于 2024-03-06 09:54:18 发布
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分类专栏： C语言学习笔记 文章标签： 压缩 c
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BWT（Burrows-Wheeler Transform）变换通过添加美元符号并进行字符串移动及排序来实现。在排序后取最后一列作为BWT结果。还原过程中，从BWT结果找到美元符号，按顺序找到对应字符，逐步构建原始字符串。压缩方面，由于BWT的特性，可以用于数据压缩，但直接使用矩阵操作可能空间消耗大。
摘要由CSDN通过智能技术生成
BWT(Burrows-Wheeler Transformation)

BWT变换：通过某一种变换得到新的字符串

以英文单词为例

在其末尾我们给它添加一个美元符号"$"变成：

  将字符串往右依次移动一个字符，重复上述工作变成：

      取其最小正周期

      我们对其排序，规定"$"比任何字母都要小。以字典顺序排序后得到：

       取其

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Burrows-Wheeler 压缩(转换)算法(BWT)
binks_的博客
12-22 7247
一.什么是BWT算法？Burrows–Wheeler变换（BWT，也称作块排序压缩），是一个被应用在数据压缩技术（如bzip2）中的算法。该算法于1994年被Michael Burrows和David Wheeler在位于加利福尼亚州帕洛阿尔托的DEC系统研究中心发明。它的基础是之前Wheeler在1983年发明的一种没有公开的转换方法。当一个字符串用该算法转换时，算法只改变这个字符串中字符的顺序而
BWT (Burrows–Wheeler_transform)数据转换算法
weixin_34023982的博客
06-03 674
1.什么是BWT  　　压缩技术主要的工作方式就是找到重复的模式，进行紧密的编码。 　　BWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个相似的文本，转换后使得相同的字符位置连续或者相邻，之后可以使用其他技术如：Move-to-front transform 和 游程编码 进行文本压缩。 2.BWT原理 2.1 BWT编码  　　(1)首先，BWT先对需要...
BWT数据压缩算法
天使爱美丽
08-20 1250
在全文检索中通常要对索引进行压缩存储，在压缩之前如果对文本进行一定的可逆变换能够使之更易压缩，BWT就是这样一种变换.     通过一个例子来介绍BWT,假设一段待转换的文本为:ababc, 则BWT的过程如下:   在T后插入结束符#得到新的文本串T#,循环左移,每次一位,得到一个|T#|行的矩阵,按首字母排序得到M   F = first column of M ...
BWT压缩算法及FM搜索算法详解
chuanglan的专栏
10-30 7733
BWT压缩算法其经典地位无可撼动， 关于数据
C语言经典算法之BWT（Burrows-Wheeler Transform）变换
最新发布
weixin_56154577的博客
03-06 1397
Burrows-Wheeler 变换（BWT，Burrows-Wheeler Transform）是一种用于数据压缩的预处理步骤，它通过重新排列输入文本来构建新的序列，以便于后续进行高效的压缩。
BWT.rar_BWT MATLAB_BWT压缩_BWT编译_arithmetic codec_bwt
09-23
编码过程会将原始文本转换为BWT形式，而解码则能将BWT编码后的数据还原回原始文本。 算术编码是一种熵编码方法，它将连续的概率分布映射到[0, 1)区间内的实数，有效地利用了二进制位流。在本压缩包中，`arithintcod...
dwt.rar_bwt
09-14
- 提取：从BWT处理过的数据中，根据嵌入时的规则找出水印并还原。 6. **MATLAB实现**：MATLAB提供了一个强大的环境来实现这样的算法，通过编写.m文件，用户可以直接操作矩阵，方便地实现BWT和其他数学变换。 综上...
任意格式文件压缩与解压
10-08
- **熵解码**：在解压缩时，根据编码表还原原始数据。 3. **C语言编程**： - C语言是一种底层、高效的编程语言，适用于系统级编程和文件操作。 - 文件I/O操作：`fopen()`, `fclose()`, `fread()`, `fwrite()` 等...
BWT 转换 源代码
12-10
BWT 转换 源代码,包括bzip2代码及可执行程序。
bcm:最终的基于BWT的文件压缩器
05-05
BCM v1.60 描述 BCM是一种高性能文件压缩器，它利用高级上下文建模技术来实现很高的压缩率。 总而言之，它就像BZIP2的老大哥。 快速基准 压缩尺寸 原来的 100,000,000字节 GZIP -9 36,445,248字节 BZIP2 -9 29,008,758字节 7-Zip Ultra 24,864,804字节 BCM -9 20,789,667字节 作者 伊利亚·穆拉维约夫（Ilya Muravyov） 谢谢 特别感谢Ilya Grebnov，Yuta Mori，Matt Mahoney，Eugene Shelwien，Alexander Rhatushnyak，Przemyslaw Skibinski，Malcolm Taylor和LovePimple。
BWT完整算法
06-03
BWT的完整算法，包括SA，Occ等数组的建立。用于在基因链中快速匹配基因。
BWT变换及其应用
weixin_42189773的博客
12-13 2081
Burrows-Wheeler变换及其应用 引言 在数学中，经常需要对研究的对象做一些变换，使得问题的处理变得更简单，例如最常见的Fourier变换可以将信号从时域信号变换为频域信号。Burrows-Wheeler变换（后面简称BWT）也是一种变换，它接收一个串，输出一个变换后的串，BWT最开始被用在压缩算法，后来在index上也有很重要的应用。 BWT的过程 step1：产生所有输入串的循环串 ...
一阶BWT过程
weixin_41640583的博客
02-13 1643
 BWT是一种以数据块为操作对象的可你的数据变换方法，其核心思想是对字符串循环移动后得到字符矩阵进行排序和变换。也就是对参考基因组进行了一次有规律的重新排序，变换的目的就是为了方便后续进行查找。 一阶BWT构造和查找的具体过程如下：一、BW变换（编码）：1.在源文本T后面添加一个额外的字符‘$’，定义该字符比源文件中所有字符都要小。2.文本T$做循环移动（每次一个字符）形成新的文本，原始文本T$和...
BWT转换对字符串进行编码
weixin_34279246的博客
03-07 578
今天看了下bowtie 的论文， 里面描述了BWT转换的过程和bowtie的比对算法； NGS测序数据的数据量非常大， 为了更快的处理， 通常需要对数据进行压缩；而BWT实际上就是一种数据转换方法， 将原始序列经过BWT转换后， 可以更方便的进行压缩；而且BWT转换是一个可逆的转换，能够根据转换后的序列还原出原始序列； BWT转换首先将序列进行在序列的末尾插入一个字符，并且规定按照字典序的排...
Python实现BWT算法（）
Mysian的专栏
01-14 1908
# coding=utf-8 def BWTEncode(str):     str = str + '#'     size = len(str)     bwtstr = ['0'] * size     result = []     result.append(str)     for j in range(size):         for i in range
bwt转成html,[IR] BWT+MTF+AC
weixin_33603105的博客
06-11 339
BWT Idea:ide压缩技术主要的工做方式就是找到重复的模式，进行紧密的编码。postBWT(Burrows–Wheeler_transform)将原来的文本转换为一个类似的文本，转换后使得相同的字符位置连续或者相邻；编码以后可使用其余技术如：Move-to-front transform和游程编码(RLE) 进行文本压缩。url通常压缩能够将文本先使用Burrows–Wheeler tr...
C#:实现BurrowsWheelerTransform（BWT）压缩算法(附完整源码)
希望我的博客，能帮上你解决学习中工作中所遇到的问题
09-05 240
C#:实现BurrowsWheelerTransform（BWT）压缩算法(附完整源码)
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