Python实现BWT算法（）

最新推荐文章于 2024-03-06 09:54:18 发布

Mysian

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文章标签： python 算法 bwt

本文链接：https://blog.csdn.net/Mysian/article/details/50514234

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本文介绍了如何使用Python实现Burrows-Wheeler转换（BWT）算法，包括编码和解码过程。首先定义了BWTEncode函数进行BWT编码，接着通过getf和getlf函数获取首字符和末字符序列，最后的BWTDecode函数完成解码。示例中展示了对字符串'banana'的BWT编码和解码操作。

摘要由CSDN通过智能技术生成

# coding=utf-8


def BWTEncode(str):
    str = str + '#'
    size = len(str)
    bwtstr = ['0'] * size
    result = []
    result.append(str)
    for j in range(size):
        for i in range(size):
            if i == size-1:
                bwtstr[0] = str[i]
            else:
                bwtstr[i+1] = str[i]
        bstr = ''
        for i in range(len(bwtstr)):
            bstr += bwtstr[i]
        if j == size-1:
            break
        else:
            result.append(bstr)
            str = bstr
    result = sorted(result)
    l = ''
    for i in range(len(result)):
        l += result[i][-1]
    return l


def strtolist(str):
    result = []
    for i in range(len(str)):
        result.append(str[i])
    return result


def listtostr(list)