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原创 Win10(64位)系统下安装Pymol(1.8.6)
获取Anaconda(Python3.6)和pymol-1.8.6.1-cp36-cp36m-win_amd64.whlAnaconda最好去下载清华提供的镜像,网速会很快,安装Anaconda3-4.4.0-Windows-x86_64.exeAnaconda3-4.4.0-Windows-x86_64.exe下载地址:点击打开链接pymol-1.8.6.1-cp36-cp36...
2017-06-30 20:52:15 11667 5
原创 Linux(CentOS 7)(64位)系统下安装Pymol(1.8.6)
PyMOL简介PyMOL是一款生物大分子三维结构显示软件,其中“Py”是指此软件使用Python语言编写,“MOL”是指Molecule。PyMOL官网是http://www.PyMOL.org/,发展历史和软件更新动态可在此查询。PyMOL的学习网站是http://www.PyMOLwiki.org/index.php/Main_Page,若想用好PyMOL,此网站是必上...
2017-06-17 18:18:25 7220 3
原创 CentOS 7(64位)系统中安装AutoDockTools(MGLTools)
硬件环境:获取安装包:官网:http://mgltools.scripps.edu/downloads点击打开链接CentOS 7(64位)系统中安装MGLTools获取root权限; 进入安装包所在文件夹; 赋予权限; 运行安装。su root #获取root权限chmod 755 mgltools_Linux-x86...
2017-06-11 18:35:04 7869 1
原创 CentOS7(64位)安装NVIDIA显卡驱动和CUDA8.0
硬件环境:显卡驱动下载;http://www.geforce.cn/drivers点击打开链接CUDA下载:https://developer.nvidia.com/cuda-downloads点击打开链接CentOS7(64位)安装NVIDIA显卡驱动和CUDA-8.0检查是否安装了GPU:lspci | grep -i nvidia...
2017-06-11 15:37:12 30934 2
原创 Amber16和AmberTools16在CentOS 7下GPU加速版的安装
AMBER分子动力学程序包是由加州圣弗兰西斯科大学(University of California San Francisco,UCSF)的Peter A Kollman和其同事编写的,程序很全,大约包含60多个程序,相互协调工作。现在已经发展到版本17。AMBER功能涵盖种类非常多的生物分子,包括蛋白、核算以及药物小分子。硬件环境:硬件环境:编译依赖yum ins...
2017-06-11 14:07:07 4936 1
原创 Gromacs 5.1.4 在CentOS7下GPU加速版的安装
GROMACS是一个用于分子动力学模拟和能量最小化的计算引擎. 分子动力学模拟和能量最小化是计算化学和分子建模领域众多技术中的两种. 计算化学 是计算技术在化学中应用, 涉及范围从分子的量子力学到复杂大分子聚集体的动力学. 分子建模 是用实际的原子模型描述复杂化学体系的一般方法, 其目的是以原子尺度的详细知识为基础, 理解和预测物质的宏观性质. 通常, 分子建模被用于设计新的材料, 因为在这过程中...
2017-06-11 13:49:50 6084
原创 CentOS 7下安装UCSF Chimera
UCSF Chimera是一个可高度延伸的程序,用于分子结构和相关数据的交互式可视化和 分析。主要包括:密度图,超分子组合,顺序排列,对接结果,轨迹和构象ensemble。也可以生成高质量图像和动画。Chimera包括完整的程序说明书和几个教程。UCSF Chimera官网:http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/点击打开链接Chimera安...
2017-06-10 22:11:21 6233 1
原创 CentOS 7系统中安装AutoDock Vina
AutoDock Vina官网:http://vina.scripps.edu/index.html点击打开链接AutoDock Vina安装包下载点击打开链接CentOS 7(64位)下安装AutoDock Vinacd autodockvinatar xzvf autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz./autodock_...
2017-06-10 20:52:05 4241 3
RDKit Documentation Release 2019.09.1.pdf
2019-12-26
基于神经网络的溶解度预测和回归分析的数据集文件
2018-09-16
pymol-2.1.0-cp36-cp36m-win
2018-05-18
2017-Bioinformatics-Volume II- Structure, Function, and Applications
2018-05-18
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