Molecular Libraries
DrugAI
Fight Disease With Code ! Fight Disease With Data Technology !
药学、医学、化学和生物与计算机和AI交叉的爱好者从业者。
展开
-
PubChem分子库
PubChemPubChem,即有机小分子生物活性数据,是一种化学模组的数据库,由美国国家健康研究院( US National Institutes of Health,NIH)支持,美国国家生物技术信息中心负责维护。PubChem数据库包括 3个子数据库: PubChem BioAssay 库用于存储生化实验数据,实验数据主要来自高通量筛选实验和科技文献; PubChem Compoun...原创 2017-08-13 17:27:34 · 31966 阅读 · 2 评论 -
虚拟筛选涉及的小分子数据库
药物设计和虚拟筛选依赖化学信息学和生物信息学中大量的靶点、小分子以及靶点-小分子相互作用星系。从大量的有机化合物中有效地遴选出可能有候选化合物,避免了对化合物盲目地活性筛选,从而降低了发现活性先导化合物的人力、时间和财力成本。本文简单介绍一些药物设计和虚拟筛选设计的分子库。Virtual Screening protocol非商业数据库ZINC 点击打开链接ZINC15...原创 2017-08-27 14:31:59 · 32334 阅读 · 3 评论 -
利用openbabel2.4.1进行小分子构象搜索
利用open babel产生小分子多重构象的方法有两种:一,使用遗传算法(遗传算法)进行构象搜索,属于系统式搜索最低能量构象的方法obabel -L conformer命令可以详细查看conformer插件的使用方法以下命令可以为小分子生成20个小分子构象,然后使用-writeconformers参数将所有的构象写成输出结构文件:obabel ligand.mol2 -O l...原创 2018-08-22 19:42:45 · 4564 阅读 · 0 评论