Ubuntu16.04+cuda8.0+opencv3.0.0 caffe编译的那些坑

前言

人生在于折腾!

最近突然想体验一下ubuntu16.04的使用感觉，就重装了操作系统。原本在ubuntu14.04的时候，按照实验室欧大神的博客一路畅通，但此次的caffe编译之旅，可谓到处是坑，遂将这些记录下来。

主要安装路线，依然是按照这篇博客的顺序：http://blog.csdn.net/shiorioxy/article/details/52652831

安装填坑：

由于我在编译opencv时，想进行多版本的管理，故没有将opencv的安装位置设在/usr/local/中，而是自定义的位置，这需要在以后编译caffe时，在makefile.config中对动态链接库进行配置。

其他主要问题：

1. gcc  g++版本问题

ubuntu16.04自带的gcc和g++为5.4.0，但是cuda8.0目前还不支持5以后的版本。如果按照欧博为了兼容matlab2014而降级到gcc4.7的话，编译opencv3.0.0时会出现：

/usr/bin/ld:cannot find -latomic    这是因为gcc4.7还没有正式支持atomic，以后才有新的支持。

我在编译opencv的时候降级到4.9.3.编译opencv没有问题了，但是在编译caffe-master时又会出现l类似下面这样的未定义引用错误：

undefined reference to `google::protobuf::io::CodedOutputStream::WriteStringWithSizeToArray