题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=3341
题目大意:题目描述十分幽默,特别是Spring Brother,笑翻了。言归正传,题目给出n个数论DNA序列,含这些序列则可以增加数论水平,含几个就几级,再给出一个长为L的基因,问这个基因重组之后的最大数论水平是多少,如果一个DNA序列在基因中出现多次也要累加起来。
解题思路:这题乍一看,没什么思路,但膜拜了下Spring Brother,思路就来了。由于是重组,那么就可以抽象出这题的模型:用基因里的A个A,B个C,C个G,D个T组成一个长度为L的字符串,使得这个字符串含最多的数论DNA序列。想到模型之后,就可以想实现,如果我们暴力得一个一个枚举,那复杂度高得离谱。由于重组后长度为L的字符串是由长度为L-1的字符串改造而来,而长度为L-1的字符串是由长度L-2的字符串改造而来,以此类推,后面的结果不影响前面的,无后效性并且状态明显,想着用DP。
设Dp[i][j]表示A个A,B个C,C个G,D个组成一个唯一的i(其实就是状态压缩),并且在AC自动机上的j位置的最高数论水平。那么状态转移方程为:
dp[i+hash[x]][j] = max(dp[i+hash[x]][j],dp[i][j] + j的子节点的危险系数(即几个串在这里结束)(0 < j < total,0 < x < 4,hash[x]为1个x基因的hash值)。
想出状态转移方程,就好办了。先将各个DNA碱基的数量压缩成一个数t,然后从0-t去遍历,再在trie图上进行状态转移。最坏复杂度为O(500*11^4*4)。
测试数据:
2
AAA
AAG
AAAG
A
TG
TGAATG
A
G
C
T
AGT
1
AA
AAA
1
AAA
AAA
1
A
ACT
代码:
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#define max(a,b) (a) > (b) ? (a) : (b)
struct node {
int flag,in;
node *next[5],*fail;
}*q[500010],trie[1050];
char sub[100],str[1010];
int num[4],sum,hash[4];
int total,head,tail,dp[15000][510];
inline int code (char c) {
switch(c){
case 'A': return 0;
case 'C': return 1;
case 'G': return 2;
case 'T': return 3;
}
return 0;
}
inline node *new_node() {
trie[total].in = total ;
trie[total].flag = 0;
trie[total].fail = NULL;
for (int i = 0; i < 4; ++i)
trie[total].next[i] = NULL;
return &trie[total++];
}
void Insert(char *str,node *root) {
int i = 0,k;
node *p = root;
while (str[i]) {
k = code(str[i++]);
if (p->next[k] == NULL) p->next[k] = new_node();
p = p->next[k];
}
p->flag++;
}
void Auto_Ac(node *root) {
root->fail = NULL;
q[head++] = root;
while (head != tail) {
node *temp = q[tail++]; //获取头结点
for (int i = 0; i < 4; ++i) {
if (temp->next[i] != NULL) {
if (temp == root) temp->next[i]->fail = root;
else {
temp->next[i]->fail = temp->fail->next[i];
temp->next[i]->flag += temp->next[i]->fail->flag;
}
q[head++] = temp->next[i];
}
else {
if (temp == root) temp->next[i] = root;
else temp->next[i] = temp->fail->next[i];
}
}//for i
}//while !=
}
int Solve_1A() {
int i,j,k,t,ans,ACTG[4];
int A,B,C,D,hash[4];
hash[3] = 1;
hash[2] = hash[3] * (num[3] + 1); //比前面一个碱基压缩成的数大
hash[1] = hash[2] * (num[2] + 1); //比前面二个碱基压缩成的数大
hash[0] = hash[1] * (num[1] + 1); //比前面三个碱基压缩成的数大
t = hash[0] * num[0] + hash[1] * num[1];
t += hash[2] * num[2] + hash[3] * num[3];//压缩成的总和
//初始化,ans设为0,最差的情况就是0了
memset(dp,-1,sizeof(dp));
ans = dp[0][0] = 0;
for (i = 0; i <= t; ++i) {
ACTG[0] = i / hash[0],ACTG[1] = (i % hash[0]) / hash[1];
ACTG[2] = (i % hash[1]) / hash[2],ACTG[3] = i % hash[2]; //D = i % hash[2] / hash[3]
if (ACTG[0] > num[0] || ACTG[1] > num[1]
|| ACTG[2] > num[2] || ACTG[3] > num[3]) continue;
for (j = 0; j < total; ++j) if (dp[i][j] != -1){
for (k = 0; k < 4; ++k) {
node *p = trie[j].next[k];
if (ACTG[k] < num[k] && dp[i+hash[k]][p->in] < dp[i][j] + p->flag) //A多一个,转移
dp[i+hash[k]][p->in] = dp[i][j] + p->flag;
}
}
}
for (i = 0; i < total; ++i)
ans = max(ans,dp[t][i]);
return ans;
}
int main()
{
int i,j,k,n,cas = 0;
while (scanf("%d",&n) ,n) {
total = head = tail = 0;
node *root = new_node();
for (i = 1; i <= n; ++i)
scanf("%s",sub),Insert(sub,root);
Auto_Ac(root);
scanf("%s",str);
memset(num,0,sizeof(num));
for (i = 0; str[i]; ++i)
num[code(str[i])] ++;
printf("Case %d: %d\n",++cas,Solve_1A());
}
}
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