R语言基础变量讲解

向量:

a=c(1,2,3)

a=c(1,'a',2) # 最终都变为字符型

a=1:10 #创建一个向量,里面包括10个元素

给向量加一个维度,就会变成一个矩阵。

> a=1:10
> a
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10
> dim(a) = c(5,2)
> a
     [,1] [,2]
[1,]    1    6
[2,]    2    7
[3,]    3    8
[4,]    4    9
[5,]    5   10

class查看变量类型,str查看变量结构

$用来取元素的列

有选择性地选择索引

> a = 1:10
> dim(a)=c(2,5)
> a
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    3    5    7    9
[2,]    2    4    6    8   10
> #有选择性的选择索引
> a[,c(T,F,T,F,T)]
     [,1] [,2] [,3]
[1,]    1    5    9
[2,]    2    6   10

grep用于数据搜索

例1:

#使用grep搜索数据框a中,Assay_Type里面行名为RNA-Seq的数据
grep('RNA-Seq',a$Assay_Type) #取出来的是下标
grepl('RNA-Seq',a$Assay_Type) #结果是一堆TRUE或者FALSE

例2:

#单细胞测序中的使用场景,用于将数据集分离
control <- colnames(seurat_obj1)[grep(".1",colnames(seurat_obj1))]
control_data <- seurat_obj1[,colnames(seurat_obj1) %in% control]

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