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RSS订阅原创 使用python批量计算表型数据数量、平均值、标准差、最小值、最大值
window环境下安装Git和Python（Linux中安装过python亦可）表型数据文件夹下鼠标右键打开Git Bash Here。3. 结果文件summary_stats.txt。输入python py.py，回车。1.表型数据文件格式（有列名）2.2 py.py代码。
2024-04-27 15:56:12
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原创 BLUPF90基因型文件
在使用BLUPF90软件进行遗传评估时（GBLUP、ssGBLUP），有时会需要准备基因型文件如snp.ped、snp.map，本文介绍两个制作blupf90所需基因文件的方法。
2023-12-11 20:15:44
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原创 利用bedtools筛选基因组数据中显著区域与QTL交集区域
例如，bedtools允许人们从广泛使用的基因组文件格式（如BAM、BED、GFF/GTF、VCF）的多个文件中交叉、合并、计数、互补和基因组区间。虽然每个单独的工具被设计用来做一个相对简单的任务（例如，与两个区间文件相交），但通过在UNIX命令行上结合多个bedtools操作可以进行相当复杂的分析。第五列：ROH_high.bed 中的区域起始位置。第二列：QTL_BED.bed 中的区域起始位置。第三列：QTL_BED.bed 中的区域终止位置。第一列：QTL_BED.bed 中的染色体名称。
2023-03-30 22:24:20
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原创 基于IBS矩阵 在R语言中构建NJ进化树 写出nwk文件
使用plink进行IBS矩阵的构建；基于IBS矩阵，在R语言构建nj进化树，并写出nwk文件；将nwk文件在itol网站上进行美化。
2023-01-26 00:02:27
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空空如也
空空如也
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