按组平均 绘制物种水平circos图 (网页版)

准备：

(1) 某水平的丰度表

(2)网址： 马戏团简介，功能和用途 CIRCOS 循环基因组数据可视化

首先了解一下这个网址提供的上传文件的格式：

小歪自己准备的数据是一个科水平的绝对丰度的表（相对丰度也可以成10 的n次方）

1、首先确定自己想要的水平，将物种分类汇总至自己想要的水平。

分类汇总可以在excel的分类汇总功能里做，但是有时asv的数量太多，小歪习惯性用Rstudio。

2、按需求进行处理

小歪需要前10 的科，且不能有f_un。处理方法是将前10个没有f_un的科在表中展示，其余的科皆隐藏进others中。

小歪总共有两组L与H组，每组16 个样。按组求平均值，得右表。

    

3、准备上传文件

重点来了。我们回到第一张图，除了纯文本，非负数整数、字母开题都不是重点，重点在最后一行——“按顺序显示”！！！！

可以手动排序，必然从大到小呀。（下左图，将会按照黄色的数字顺序进行排序）。

下右图，B列，将科名改为了A-J的排列。（小歪不知道为啥，这样试了一下才没有报错）

而且行、列名之间不能有重复，所有HH 与H 进行了区分

    

 保存为TXT格式

4、上传网页，出图

网站的位置和上传文件的位置，用黄色的笔画出来了

选择文件后，要打两个勾（不打会报错）

 

 点可视化表格，30秒-1分钟出图

黑笔圈圈可以下载图片svg等；红色圈圈可以进行美化设计。小歪是准备下载SVG，使用AI进行ABCD 与科名的转换的。